Inligting

Wat beteken dit om vierkantige hakies om 'n genusnaam te hê?

Wat beteken dit om vierkantige hakies om 'n genusnaam te hê?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Byvoorbeeld [Eubacterium] rectale


Die NCBI Taksonomie-personeel plaas vierkantige hakies om die genus vir sommige spesies (voorbeelde: [Bacillus] aminovorans, [Candida] auris) om aan te dui dat hulle verkeerd geklassifiseer is*, wat beteken dat hulle verkeerd in 'n hoër taksonomiese rang geplaas is.

Verwysings:

https://support.nlm.nih.gov/knowledgebase/article/KA-03379/en-us


Vertrouensintervalle verduidelik

Gepubliseer op 7 Augustus 2020 deur Rebecca Bevans. Hersien op 11 Februarie 2021.

Wanneer jy 'n skatting in statistiek maak, of dit nou 'n opsommende statistiek of 'n toetsstatistiek is, is daar altyd onsekerheid rondom daardie skatting omdat die getal gebaseer is op 'n steekproef van die populasie wat jy bestudeer.

Die vertrouensinterval is die reeks waardes wat jy verwag dat jou skatting tussen 'n sekere persentasie van die tyd sal val as jy jou eksperiment weer uitvoer of die populasie weer op dieselfde manier steekproef.

Die vertroue vlak is die persentasie kere wat jy verwag om 'n skatting tussen die boonste en onderste grense van die vertrouensinterval weer te gee, en word gestel deur die alfawaarde.


Rekordbeskrywing in GenPept-formaat

  • Toetredingsformaat: WP_ + 9 syfers die onderstreep '_' is deel van die toegangsnommer.
  • Weergawe nommer: die weergawenommer is altyd 1.
  • DEFINISIE reël: die definisielyn sluit die proteïennaam in, gevolg deur 'n organismenaam tussen vierkantige hakies ([ ]). Die organisme kan op die vlak van spesie tot super-koninkryk geïdentifiseer word en weerspieël nie stamspesifieke inligting nie. Hierdie lyn kan 'n voorvoegsel 'MULTISPECIES:' insluit as die proteïenrekord op genome van verskillende spesies geannoteer is. As die proteïen op genome van verskillende super-koninkryke geannoteer word, word elke super-koninkryk se naam in aparte vierkantige hakies verskaf. Sien asseblief die voorbeeld hieronder.
  • SLEUTELWOORDE: RefSeq CROSS_KINGDOM (opsioneel, voorbeeld WP_041895446.1)
  • DBSOURCE: hierdie lyn word nie verskaf nie.
  • ORGANISME: hierdie lyn rapporteer inligting op die vlak van superkoninkryk aan spesies en sluit nie stamspesifieke inligting in nie.
    • Die genus spesies naam word voorgestel wanneer die proteïen op een tot veelvuldige stamme of isolate van dieselfde spesie gevind word (voorbeeld WP_000091939.1).
    • Die laagste algemene taksonomiese nodus word aangedui wanneer 'n nie-oortollige proteïen in veelvuldige spesies gevind word (voorbeeld WP_003547430.1).
    • Twee organismeblokke word voorsien vir proteïene wat op genome van verskillende koninkryke geannoteer is (byvoorbeeld WP_041895446.1).
    • REFSEQ: Hierdie rekord verteenwoordig 'n enkele, nie-oortollige, proteïenvolgorde wat op baie verskillende RefSeq-genome van dieselfde of verskillende spesies geannoteer kan word.
    • 'n Enkelbronkenmerk word verskaf wanneer die nie-oortollige proteïen op genome binne 'n enkele superkoninkryk gevind word (bv. WP_003547430.1 of WP_000091939.1)
    • Die organisme en NCBI tax_id wat aangedui word, weerspieël die laagste algemene vlak, vir die stel genome waarop die proteïen geannoteer is.
    • Die mees spesifieke organisme inligting verskaf is die genus spesie binomiale stam-spesifieke inligting is nie ingesluit op nie-oortollige proteïen rekords.
    • Die organisme-inligting kan op die genus-, familie- of ander taksonomiese vlak wees. Dit gaan gepaard met die insluiting van 'MULTISPECIIES' voorvoegsel in die DEFINISIE-reël.
    • Veelvuldige bronkenmerke word verskaf wanneer 'n nie-oortollige proteïen op genome van verskillende super-koninkryke geannoteer word. Dit word vergesel van die 'CROSS_KINGDOM'-sleutelwoord en veelvuldige ORGANISME-blokke (bv. WP_041895446.1)

    1) Nie-oortollige RefSeq-proteïen gevind in 'n enkele stam (WP_032359739.1). Die DEFINISIE, ORGANISME en bronkenmerke rapporteer die spesie.

    2) Nie-oortollige RefSeq-proteïen gevind in veelvuldige spesies van die genus Rhizobiaceae (WP_003547430.1). Die DEFINISIE, ORGANISME en bronkenmerke rapporteer die genus.

    3) Nie-oortollige RefSeq-proteïen gevind in genome van beide die Archaea en Bacteria super-koninkryke (WP_041895446.1). Let daarop dat die DEFINISIE-lyn twee super-koninkryke rapporteer, elk binne vierkantige hakies. Daar is twee ORGANISME-blokke, en daar is twee bronkenmerkblokke.


    Britse Engels
    ( ) = ronde hakies of hakies

    Amerikaanse Engels
    ( ) = hakies

    Ronde hakies word basies gebruik om ekstra inligting by 'n sin te voeg. Kyk na hierdie voorbeelde:

    1. verduidelik of verduidelik
      • Tony Blair (die voormalige Britse premier) het in 2007 uit sy amp bedank.
    2. dui meervoud of enkelvoud aan
      • Los asseblief jou selfoon(s) by die deur.
    3. voeg 'n persoonlike opmerking by
      • Baie mense hou van partytjies (ek doen nie).
    4. definieer afkortings
      • Die saak sal deur die IOK (Internasionale Olimpiese Komitee) beslis word.

    Sommige grammatici glo dat ons (waar moontlik) kommas moet gebruik.
    Sommige grammatici glo dat ons, waar moontlik, kommas moet gebruik.

    Onthou dat die punt, uitroepteken of vraagteken na die laaste hakie gaan (tensy die hakies 'n volledige sin bevat). Kyk na hierdie voorbeelde:

    • My kar is in die ry (met die venster oop).
    • Ek het sopas 'n ongeluk gehad met ons nuwe kar. (Sssh! My man weet nog nie.)
    • Die weer is wonderlik. (As dit maar altyd so was!)
    • Die partytjie was fantasties (soos altyd)!
    • Onthou jy vir Johnny (my broer se vriend)?
    • Johnny het ook gekom. (Onthou jy Johnny?) Ons het heerlik gekuier.

    Waarom is die NCBI-genome FTP-werf herorganiseer?

    Histories is die genome FTP-werf bevolk deur verskillende prosesvloeie en NCBI-werkgroepe wat gelei het tot ongewenste verskille in beskikbare inhoud en lêerformate. Data vir GenBank-genome en RefSeq-genome is ook in verskillende areas van die NCBI FTP-terrein geleë wat verskillende organisasie gehad het.

    NCBI het die genomes FTP-werf herontwerp om die inhoud uit te brei en datatoegang te vergemaklik deur 'n georganiseerde voorspelbare gidshiërargie met konsekwente lêername en -formate. Die webwerf bied nou groter ondersteuning vir die aflaai van saamgestelde genoomvolgordes en/of ooreenstemmende annotasiedata met meer eenvormigheid oor spesies heen. Die huidige FTP-werfstruktuur bied 'n enkele toegangspunt om toegang te verkry tot inhoud wat óf GenBank- óf RefSeq-data verteenwoordig.

    Die aanvanklike vrystelling van die herontwerpte genomes FTP-werf in Augustus 2014 het drie nuwe dopgehou, naamlik 'genbank', 'refseq' en 'almal' by die bestaande ftp-area gevoeg – ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ genome/. Hierdie gidse verskaf 'n kernstel van lêers wat beide volgorde en annotasie-inhoud in verskeie formate verteenwoordig (sien hieronder). Bykomende lêerformate is bygevoeg in daaropvolgende opdaterings.

    Die inhoud van die meeste van die ou gidse op die ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/-werf, en die inhoud voorheen by ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes / word nie meer opgedateer nie. Baie ou gidse van hierdie twee gebiede is op 2 Desember 2015 na argiefsubgidse binne die /genome/-area geskuif. Die meeste van die oorblywende ou gidse is in Maart 2020 na die argief geskuif. Besonderhede van watter FTP-gidse en lêers geskuif is, is soos volg .

    • Alle gidse en lêers vanaf ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/genomes/ is geargiveer na ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/archive/old_genbank
    • Die volgende dopgehou vanaf ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ is geargiveer na ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/archive/old_refseq/
      • alle Genus_spesies dopgehou
      • ASSEMBLY_BACTERIA
      • Bakterieë
      • Bakterie_konsep
      • Chloroplaste
      • KLUSTERS
      • Swamme
      • MITOCHONDRIA
      • PLANTE
      • Plasmiede
      • Protosoë

      Vierkante hakies ([fubar]) word oor die algemeen gebruik vir wat bekend staan ​​as smal transkripsie - dit sluit soveel detail in as wat die transkribeerder voel nodig is. Skerpe (/fubar/) verteenwoordig die breed transkripsie, wat nie "voorspelbare" inligting insluit nie.

      Byvoorbeeld, in Engels word stemlose plosiewe aanvanklik en in beklemtoonde beginwoorde geaspireer. Dus, 'n smal transkripsie van "cool" kan [kʰul] wees, terwyl 'n breë transkripsie /kul/ sal wees. Net so kan "lack" as [læk] en /læk/ voorgestel word - let op dat breë /k/ nou [k] of [kʰ] kan word, afhangende van die posisie daarvan in die woord en omringende klanke. Omdat hierdie inligting deur bogenoemde reël voorspelbaar is, word die aspirasie uit die breë transkripsie gelaat.

      In linguistiese beskrywing word die "breë" en "smal" benamings ietwat los gedefinieer, oor die algemeen volgens watter konvensie die taalkundige wat die taal rapporteer, voel die nuttigste is. Onder die Generatiewe Fonologie-raamwerk word egter aanvaar dat dit twee afsonderlike stadiums van fonologiese verwerking verteenwoordig, elk met 'n psigologiese werklikheid. Vierkante hakies dui die finale stadium van verwerking aan (wat na die artikuleerders gestuur word), genaamd "fonetiese transkripsie", terwyl skuinsstreepies die vorm aandui wat in die verstandelike leksikon gestoor is (gestroop van alle voorspelbare inligting), genaamd "fonemiese transkripsie".

      Om hierdie soort analise uit te voer, moet jy eers bepaal watter klanke kontrastief in die uitset is. Byvoorbeeld, in Engels is [pʰ] en [p] nie kontrastief nie, want [pʰæt] en [pæt] "pat" word deur (meeste) moedertaalsprekers as "dieselfde" beoordeel (selfs al sou [pæt] swak gevorm wees ). In Hindi is [kapʰi] "coffee" en [kapi] "copy" egter twee aparte woorde. Die generatiewe hipotese is dat elke stel nie-kontrastiewe klanke gestoor word as 'n enkele eenheid in die brein, genoem 'n foneem (in skuinsstreepies), wat omskep word in 'n finale vorm (tussen hakies) wat aan die artikuleerders oorgedra word deur 'n reeks reeksgeordende reëls of gelyktydige beperkings op die moontlike uitvoervorms.

      Ja, /fubar/ word tipies gebruik vir fonemies transkripsies, en [fubar] vir foneties transkripsies. Maar, net om die terminologie duidelik te maak, fonemies vs. foneties is nie noodwendig dieselfde ding as breë vs. smal transkripsie nie.

      Baie taalkundiges praat oor die gebruik van beide breë en nou fonetiese transkripsies, wat net verwys na die vlak van detail wat gebruik word om die werklike spraakklanke voor te stel. 'n Smal fonetiese transkripsie sal elke piepklein kenmerk van die spraakklanke verteenwoordig soos dit in 'n uiting van Taal X geproduseer is, terwyl 'n breë fonetiese transkripsie sommige van die mees opvallende kenmerke van die getranskribeerde fone sou aandui, sonder om volledig te wees, maar ook sonder om noodwendig aansprake maak oor watter segmente fonemies/fonologies kontrastief is.

      Fonemiese transkripsie, aan die ander kant, kan eintlik net wyd wees, deurdat dit slegs die klanke verteenwoordig wat na bewering kontrastief in die gegewe taal is, sonder enige detail wat nie direk relevant is vir die vorming van hierdie kontraste nie. Fonemiese transkripsie beskryf nie hoe 'n uiting eintlik klink wanneer dit geproduseer word deur 'n spesifieke spreker wat in 'n bepaalde styl praat in 'n bepaalde situasie nie - fonemiese transkripsie is die 'geïdealiseerde' voorstelling van die spraakklanke, en veronderstel om die onderliggende kontraste voor te stel wat betekenisvol is vir sprekers. Jy kan net fonemiese transkripsie doen as jy reeds heelwat werk aan Taal X gedoen het ('n reeks leksikale items versamel, 'n paar minimale pare gevind en/of die patrone van allofoniese variasie uitgewerk, ens.) want fonemiese transkripsie impliseer dat jy/iemand het besluit watter fone verband hou met kontrastiewe foneme (verskillende klanke wat in presies dieselfde omgewing kan voorkom) en watter fone voorkom as gevolg van vrye/gekondisioneerde variasie.

      Die voorbeelde wat @Alek Storm hierbo gegee het, illustreer die verskille tussen [foneties] en /fonemiese/ transkripsie - onthou net dat foneties wyd kan wees en smal.


      Hakies is enigste benodig vir verbindings wat gevorm word uit komplekse ione. Maar wat is 'n komplekse ioon? Wel, dit is 'n ioon wat uit meer as een element bestaan.

      Die mees algemene voorbeelde van komplekse ione is:

      • Hidroksied OH & # 8211
      • Sulfaat SO4 2-
      • Nitraat GEEN3
      • Karbonaat CO3 2-
      • Ammonium NH4 +

      Daar word van jou verwag om die formules van hierdie komplekse ione (en hul ladings) vir die eksamen te ken.

      As daar is net een komplekse ioon, dan is hakies nie benodig word

      Voorbeelde: NaOH MgSO4NH4GEEN3CaCO3

      As daar is meer as een komplekse ioon in die verbinding, dan hakies is benodig word

      Die rede is dat jy 'n hakie om die komplekse ioon moet sit om te wys hoeveel van daardie hele komplekse ione daar in die verbinding is.

      Dit’s dit vir hakies! Behalwe dat as jy nie seker is hoe om te besluit of daar net een ioon in 'n verbinding is nie, of twee of drie, kyk dan hier: Topwenke vir die skryf van chemiese formules waar jy sal leer oor die balansering van die ladings van positief en negatief ione.


      Wanneer word &ldquo《&rdquo en &ldquo 》&rdquo en ander hakies gebruik?

      Dit is 'n simbool om die titel, koerantnaam, lêernaam, operanaam, liedjienaam, prentnaam, boeknaam, die naam van film- en televisieprogramme, ens.
      《》 en 〈〉 word in horisontale formaat gebruik (Vertikale formaat gebruik ︽︾ en ︿﹀ ), en kan geneste gebruik word. Jy moet eers 《》 / ︽︾ gebruik, dan 〈〉 / ︿﹀ , dan 《》 / ︽︾ ,.
      Daar is ook 'n paar ander tipes 书名号, jy kan HIER na die wiki-bladsy verwys.

      Jy kan HIER na die wiki-bladsy verwys.
      Hulle word dikwels gebruik vir notas en kommentaar in artikels. En 【】 / 〖〗 word dikwels in formele referate gebruik、artikels wat deur rekenaar geredigeer is (Handgeskrewe artikels sal dit nie gebruik nie, gebruik net () , [] , ens.):

      Dit word dikwels onderaan 'n bladsy geplaas.
      〖〗 word selde gebruik, en ek is nie seker of dit vir nes met 【】 gebruik word of nie.

      Dit word gebruik om aan te haal, en soos 书名号 moet jy eers "" / 「」 gebruik, dan '' / 『』:

      Oor die algemeen word die tweede een selde gebruik. Dit word meestal gebruik om binne 'n aanhaling aan te haal. Jy kan HIER na die wiki-bladsy verwys.

      “《》” word uitsluitlik rondom name van boeke of artikels gebruik. Wanneer jy na 'n boeknaam in 'n “《》” verwys, gebruik “〈〉” (op 'n manier soortgelyk aan die gebruik van ' en ").

      Wortelhakies: 《, 》,〈 en 〉: Hulle word 书名号 genoem. @Frank het hul gebruik in sy antwoord gegee.

      Vierkante hakies: 【, 】,〖 en 〗, C-hakies: 〔 en 〕: Hulle is almal 括号.
      【, 】: 实心方头括号
      〖, 〗: 空心方头括号
      Ek het nou eers hul name in wiki gevind, aangesien dit nie gereeld gebruik word nie. Sommige van die situasies dat hulle gebruik kan word, kan in die wiki-bladsy gevind word.

      Die enigste paar 括号 wat konsekwent in artikels gebruik word, is 〔, 〕, wat ook 圆括号 genoem word. Dit word gebruik om kommentaar, annotasie, verduideliking, ens. by die vorige woord of sin te wys. Die inhoud binne sal gewoonlik geïgnoreer word wanneer die gedeelte voorgelees word.

      L-hakies: 「, 」, 『 en 』: Dit is aanhalingstekens 引号, die vorige paar is 单引号, laasgenoemde 双引号. Die gebruik is amper dieselfde as " " en ' ' , maar kan nie daarmee gemeng word nie. Op die vasteland van China sal "" en '' gebruik wees.

      'n Verdere soektog in wiki en baidubaike gee my 'n paar interessante resultate oor aanhalingstekens.

      Op die vasteland van China sal "" gebruik word. Wanneer geneste, word die aanhalingstekens op hierdie manier gebruik:

      Dit wil sê, die uitste paar is "" , die binneste een is '', en as daar 'n ander aanhalingsvlak binne '' is, sal "" weer gebruik word.

      In Hongkong en Taiwan sal 「」 gebruik word. En wanneer geneste: 「 . 『 . 』 . 」 . Ek weet nie wat om te gebruik met meer nesvlakke nie.


      2 Antwoorde 2

      Vierkante hakies is 'n snelskrifnotasie om 'n voorwaardelike toets uit te voer. Die hakies [ , sowel as [[ is werklike opdragte binne Unix, glo dit of nie.

      In Bash is die [ 'n ingeboude opdrag sowel as 'n uitvoerbare. [[ is net 'n sleutelwoord vir Bash.

      Voorbeeld

      U kan dit bevestig deur die tipe:

      Jy kan die fisiese uitvoerbare hier sien:

      Ingeboude versus sleutelwoorde

      As jy na die Bash man-bladsy kyk, man bash , sal jy die volgende definisies vir die 2 vind:

      sleutelwoorde - Gereserveerde woorde is woorde wat 'n spesiale betekenis vir die dop het. Die volgende woorde word herken as gereserveer wanneer dit nie aangehaal word nie en óf die eerste woord van 'n eenvoudige opdrag (sien SHELL GRAMMAR hieronder) of die derde woord van 'n saak of vir bevel:

      ingeboude - As die opdragnaam geen skuinsstreepies bevat nie, probeer die dop om dit op te spoor. As daar 'n dopfunksie met daardie naam bestaan, word daardie funksie opgeroep soos hierbo beskryf in FUNKSIES. As die naam nie by 'n funksie pas nie, soek die dop daarna in die lys van ingeboude dop. As 'n passing gevind word, word daardie ingeboude opgeroep.

      As die naam nie 'n dopfunksie of 'n ingeboude is nie, en geen skuinsstreepies bevat nie, soek bash elke element van die PATH vir 'n gids wat 'n uitvoerbare lêer met daardie naam bevat. Bash gebruik 'n hash-tabel om die volle padname van uitvoerbare lêers te onthou (sien hash onder SHELL BUILTIN COMMANDS hieronder). 'n Volledige soektog van die gidse in PATH word slegs uitgevoer as die opdrag nie in die hash-tabel gevind word nie. As die soektog onsuksesvol is, soek die dop vir 'n gedefinieerde dopfunksie genaamd command_not_found_handle. As daardie funksie bestaan, word dit opgeroep met die oorspronklike opdrag en die oorspronklike opdrag se argumente as sy argumente, en die funksie se uitgangstatus word die uitgangstatus van die dop. As daardie funksie nie gedefinieer is nie, druk die dop 'n foutboodskap en gee 'n uitgangstatus van 127 terug.

      Man bladsy

      As jy deur die Bash-manbladsy kyk, sal jy die besonderhede daarop vind.

      EDIT #1

      Opvolgvraag van die OP.

      Ok, so hoekom is daar dan 'n behoefte aan 'n "as"? Ek bedoel, hoekom "as" selfs bestaan ​​as "[" sou voldoende wees.

      Die as is deel van 'n voorwaardelike. Die toetsopdrag of [ . ] opdrag evalueer eenvoudig die voorwaardelike, en gee 'n 0 of 'n 1 terug. Die 0 of 1 word dan deur die if-stelling gereageer. Die 2 werk saam wanneer jy hulle gebruik.


      Jy ontsnap nie vierkantige hakies in LaTeX as jy dit wil hê nie. [ en ] is basies sinonieme vir egin en end , (of egin en end met amsmath gelaai), en sal die ingeslote inhoudtipeset in 'n ongenommerde wiskundige vergelyking op 'n aparte lyn maak, wat duidelik nie is wat jy wil hê nie.

      Ten slotte moet jy eenvoudig skryf

      woordeliks om die uitset te kry

      Wysig: Soos in die kommentaar aangedui, sal dit nie werk in die spesiale gevalle waar die hakies 'n makro volg (soos in item [2007] EWA ) of as dit eerste in 'n ry in 'n tabel kom nie. In hierdie situasies moet 'n mens die hakies binne hakies as <[2007]>EWA groepeer.