Inligting

Kan 'n bakterie 'n ander bakterie besmet?

Kan 'n bakterie 'n ander bakterie besmet?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Ek het daaroor nagevors deur op Google te soek en 'n paar bakteriologiese artikels te lees, maar ek het geen antwoord gekry nie. Ek het ook van my onderwysers gevra, en hulle was ook 'n bietjie deurmekaar. Sommige het gesê dat dit moontlik is en ander het gesê nie. Die vraag bly dus:

Kan 'n bakterie 'n ander bakterie besmet? Indien wel, hoe?


Bdellovibrio bacteriovorus (BV) "besmet" ander bakterieë:

Soortgelyk aan 'n virus, val BV bakterieë aan soos Escherichia coli (E coli) deur aan sy prooi te heg en binne te gaan, groei en repliseer binne die sel, en dan skielik uitbars en sy nageslag in die omliggende omgewing vry te stel. - Hoe bakterieë ander bakterieë jag


Let daarop dat baie van die antwoord op hierdie vraag afhang van wat jy bedoel met "besmet". Bdellovibrios (soos Laurel reeds vasgestel het dat dit doen gebeur) iets doen wat wel baie lyk soos om eukariotiese selle te besmet - maar dit word steeds as "jag" gepraat. Hoekom? Ek is nie seker nie.

Daar is baie verskillende maniere waarop bakterieë negatiewe interaksies met mekaar kan hê - alhoewel hulle dikwels meer na "jag" of "oorlogvoering" as "infeksie" lyk.

Om 'n bietjie meer in die "hoe" van die vraag te kry, 'n algemene meganisme vir inter-bakteriële negatiewe interaksie is die Tipe VI-afskeidingstelsel. Daar word dikwels van hierdie apparaat gepraat as 'n "wapen" wat bakterieë kan gebruik om mekaar dood te maak, deur aan die ander sel te kleef en gifstowwe deur sy membraan in te skiet. Hulle kan dit tot groot ekologiese effek gebruik.

Die tipe VI-afskeidingstelsel word ook in sommige kontekste gebruik om nie-bakteriële gashere te besmet, so deur daardie logika kan jy redeneer dat dit soos infeksie lyk.

Opdateer: vir 'n kort bespreking van inter-bakteriële doodmaak (insluitend Bdellovibrio + afskeidingstelsels) in die konteks van biotegnologiese toepassings, sien hier.


Bakterieë en virusse besmet ons selle deur suikers: Nou wil navorsers weet hoe hulle dit doen

Suiker is nie net iets wat ons eet nie. Inteendeel. Suiker is een van die mees natuurlik voorkomende molekules, en alle selle in die liggaam word bedek deur 'n dik laag suiker wat die selle teen bakterieë en virusaanvalle beskerm. Trouens, byna 80 persent van alle virusse en bakterieë bind aan die suikers aan die buitekant van ons selle.

Suiker is so 'n belangrike element dat wetenskaplikes daarna verwys as die derde bousteen van lewe -- naas DNS en proteïen. En verlede herfs het 'n groep navorsers bevind dat die piekproteïen in korona-virus 'n spesifieke suiker nodig het om doeltreffend aan ons selle te bind.

Nou het dieselfde groep navorsers ’n nuwe studie voltooi wat verder delf in die selreseptore waaraan suikers en dus bakterieë en virus bind.

'Ons het vasgestel hoe die suikers bind aan en aktiveer die sogenaamde Siglec-reseptore wat immuniteit reguleer. Hierdie reseptore speel 'n groot rol, aangesien hulle die immuunstelsel vertel om aktiwiteite te verminder of te verhoog. Dit is 'n belangrike meganisme in verband met outo-immuun siektes', sê die eerste skrywer van die studie, Postdoc Christian Büll van die Kopenhagen Sentrum vir Glykomika (CCG) aan die Universiteit van Kopenhagen.

Die unieke suikertaal

Wanneer die immuunstelsel verkeerde seine ontvang, kan dit lei tot outo-immuun siektes, wat is wanneer die immuunstelsel homself aanval. Die Siglec-reseptore ontvang seine via die siaalsuursuiker, 'n koolhidraat wat tipies die suikerkettings op die oppervlak van ons selle sluit. Wanneer Siglec-reseptore die regte suikerkettings ontmoet, word die immuunstelsel aangesê om te demp of te aktiveer.

'As deel van die nuwe studie het ons 'n selbiblioteek geskep wat gebruik kan word om te bestudeer hoe verskeie suikers aan reseptore bind en daarmee in wisselwerking tree. Ons het dit gedoen deur tienduisende selle te skep wat elk 'n bietjie van die unieke suikertaal bevat, wat ons in staat stel om hulle van mekaar te onderskei en hul individuele effek en proses te bestudeer. Hierdie kennis kan ons help om beter behandelingsopsies in die toekoms te ontwikkel', sê medeprofessor Yoshiki Narimatsu van CCG, wat ook bygedra het tot die studie.

'Die oppervlak van die selle in die biblioteek is dieselfde as die een wat op selle in hul natuurlike omgewing gevind word. Dit beteken dat ons die suikers in 'n omgewing met die natuurlike voorkoms van bv. proteïene en ander suikers, en ons kan dus die selle bestudeer in die vorm waarin virus en bakterieë hulle vind', verduidelik Yoshiki Narimatsu.

Belangrike ontdekking vir Alzheimer se siekte

Deur aan die nuwe studie te werk, het die navorsers die suikers geïdentifiseer wat aan die spesifieke reseptor bind wat ’n hoofrol in die ontwikkeling van Alzheimer se siekte speel.

'Ons hoofbevinding gaan oor die Siglec-3-reseptor. Dit is reeds bekend dat mutasies in die Siglec-3-reseptor 'n rol speel in verband met Alzheimer se siekte, maar ons het nie geweet waaraan die reseptor spesifiek bind nie. Ons metode het nou 'n potensiële natuurlike suiker geïdentifiseer wat spesifiek aan die Siglec-3-reseptor bind. Hierdie kennis verteenwoordig 'n belangrike stap vorentoe om die genetiese defekte te verstaan ​​wat veroorsaak dat 'n persoon die siekte ontwikkel', sê Christian Büll.

Die skepping van die suikerbiblioteke is deur die Lundbeck-stigting en die Deense Nasionale Navorsingstigting befonds.


Multi-middel-weerstandige bakterieë

Christopher Grace MD, FACP, in Critical Care Secrets (vyfde uitgawe), 2013

7 Hoe word bakterieë multi-weerstandig?

Bakterieë word bestand teen antibiotika deur DNA-mutasie op uitgesoekte punte of deur invoegings of delesies wat mikrobiese ensieme of die antibiotika-teikens verander. Genetiese materiaal kan tussen bakterieë oorgedra word deur plasmiede (ekstrachromosomale dubbelstring sirkelvormige DNA) deur direkte sel-tot-sel kontak. Bakterieë kan ook nuwe weerstandsgene verkry deur infeksie met bakteriofaagvirusse wat weerstandsgene saam met hulle dra wanneer hulle bakterieë besmet. Sodra bakterieë nuwe weerstandsgene ontwikkel of verkry, het hulle 'n selektiewe voordeel wanneer antibiotika gebruik word. Soos meer mutasies of oorgedra genetiese materiaal ophoop, hoe meer klasse antibiotika word die bakterieë weerstandbiedend teen, wat MDR veroorsaak.


Misteriemolekule in bakterieë word geopenbaar as 'n wag

Boonste ry: E coli-bakterieë wat 'n retron bevat, breek die membrane in die sel uitmekaar ongeveer 15 minute na infeksie (middel) Rooi openbaar gate in membrane soos selle sterf. (Regs) 45 minute na infeksie met 'n fage, het baie selle gesterf, maar 'n paar bly oor om groei weer te begin. Onder: bakterieë wat hierdie retron ontbreek, lyk goed na 15 minute, maar 45 minute later is die besmette selle dood en die virale DNA het uitgemors, op pad na die oorblywende paar selle. Krediet: Weizmann Institute of Science

Eiesoortige hibriede strukture genoem retrone wat half RNA, half enkelstring DNA is, word in baie spesies bakterieë aangetref. Sedert hul ontdekking ongeveer 35 jaar gelede, het navorsers geleer hoe om retrons te gebruik om enkele stringe DNA in die laboratorium te vervaardig, maar niemand het geweet wat hul funksie in die bakterieë was nie, ten spyte van baie navorsing oor die saak. In 'n koerant wat vandag gepubliseer is in Sel, 'n Weizmann Institute of Science-span doen verslag oor die oplossing van die langdurige raaisel: Retrone is immuunstelsel 'wagte' wat die oorlewing van die bakteriese kolonie verseker wanneer dit deur virusse besmet word. Benewens die ontdekking van 'n nuwe strategie wat deur bakterieë gebruik word om hulself teen virale infeksie te beskerm - een wat verbasend soortgelyk is aan dié wat gebruik word deur plant-immuunstelsels - het die navorsing baie nuwe retrons aan die lig gebring wat in die toekoms tot die genoom-redigering gereedskapstel kan bydra. .

Die studie, wat in die laboratorium van prof. Rotem Sorek van die Instituut se Molekulêre Genetika-afdeling uitgevoer is, is gelei deur Adi Millman, dr. Aude Bernheim en Avigail Stokar-Avihail in sy laboratorium. Sorek en sy span het nie daarop gemik om die retron-raaisel op te los nie hulle soek nuwe elemente van die bakteriële immuunstelsel, spesifiek elemente wat bakterieë help om virale infeksie af te weer. Hul soektog is makliker gemaak deur hul onlangse bevinding dat bakterieë se immuunstelselgene geneig is om saam te groepeer in die genoom binne sogenaamde verdedigingseilande. Toe hulle die unieke handtekening van retron binne 'n bakteriese verdediging-eiland ontbloot, het die span besluit om verder te ondersoek.

Hul aanvanklike navorsing het getoon dat hierdie retron beslis betrokke was by die beskerming van bakterieë teen die virusse bekend as fage wat spesialiseer in die infeksie van bakterieë. Soos die navorsers van naderby gekyk het na bykomende retrone wat naby bekende verdedigingsgene geleë is, het hulle gevind dat die retrone altyd fisies en funksioneel aan een ander geen gekoppel is. Wanneer óf die meegaande geen óf die retron gemuteer is, was die bakterieë minder suksesvol om faaginfeksie te beveg.

Die navorsers het toe begin soek na meer sulke komplekse in verdedigingseilande. Uiteindelik het hulle sowat 5 000 retrone, baie van hulle nuut, in verskillende verdedigingseilande van talle bakteriese spesies geïdentifiseer.

Om te kyk of hierdie retrone oor die algemeen as immuunmeganismes funksioneer, het die navorsers baie retrone, een vir een, oorgeplant in laboratoriumbakteriese selle wat nie retrons gehad het nie. Soos hulle vermoed het, het hulle in 'n groot aantal van hierdie selle retrone gevind wat die bakterieë teen faaginfeksie beskerm.

Hoe doen retrons dit? Deur terug te fokus op een spesifieke soort retron en die aksies daarvan in die lig van faaginfeksie op te spoor, het die navorsingspan ontdek dat die funksie daarvan is om die besmette sel te laat selfmoord pleeg. Selselfmoord, wat eens gedink is dat dit uitsluitlik aan veelsellige organismes behoort, is 'n laaste manier om wydverspreide infeksie te stop - as die selfmoordmeganisme vinnig genoeg werk om die sel dood te maak voordat die virus klaar kopieë van homself maak en na ander selle versprei.

Verdere ondersoek het getoon dat retrone nie die faag-indringing self waarneem nie, maar eerder 'n ander deel van die immuunstelsel, bekend as RecBCD, dophou, wat een van die bakterie se eerste verdedigingslinie is. As dit besef dat die faag met die sel se RecBCD gepeuter het, aktiveer die retron sy program deur die tweede, gekoppelde gene om die besmette sel dood te maak en die res van die kolonie te beskerm.

"Dit is 'n slim strategie, en ons het gevind dit werk op 'n soortgelyke manier as 'n beskermmeganisme wat in plantselle gebruik word," sê Sorek. "Net soos virusse wat plante infekteer, kom fage toegerus met 'n verskeidenheid inhibeerders om verskillende dele van die sel-immuunrespons te blokkeer. Die retron, soos 'n beskermmeganisme wat bekend is dat dit in plante bestaan, hoef nie alle moontlike inhibeerders te kan identifiseer nie. , net om 'n handvatsel te hê oor die werking van een spesifieke immuunkompleks. Besmette plantselle pas hierdie 'abortiewe infeksie' metode toe, wat 'n klein deel van 'n blaar of wortel doodmaak in 'n poging om die plant self te red. Aangesien die meeste bakterieë lewe in kolonies kan dieselfde strategie die voortbestaan ​​van die groep bevorder, selfs ten koste van individuele lede."

Retrone is so nuttig vir biotegnologie omdat hulle begin met 'n stuk RNA, wat die sjabloon is vir die sintese van die DNA-string. Hierdie sjabloon in die retron-volgorde kan uitgeruil word vir enige verlangde DNS-volgorde en gebruik word, soms in samewerking met 'n ander instrument wat geleen is van die bakteriese immuun-gereedskapstel—CRISPR—om gene op verskeie maniere te manipuleer. Sorek en sy span glo dat binne die uiteenlopende lys van retrons wat hulle geïdentifiseer het, dalk meer as 'n paar verberg wat beter sjablone vir spesifieke geenredigeringsbehoeftes kan verskaf.


Inleiding

Bakterieë (ook bekend as prokariote) is die Aarde se oudste organismes. Hulle is veral bekend as plae wat dodelike siektes veroorsaak. Wat egter onlangs ontdek is, is dat bakterieë ook lewegewend is. Groot gemeenskappe bakterieë leef in en op hoër organismes (soos jy) in samestellings wat mikrobiome genoem word. Mikrobiome is van kardinale belang vir menslike, dier- en plantgesondheid omdat mikrobioombakterieë hul groter gashere van lewensbelangrike stowwe voorsien. Wetenskaplikes dink nou dat meersellige lewe op Aarde saam met bakterieë ontwikkel het en dat die lewens van mense en bakterieë intiem verweef is.

Maar hoe kan bakterieë, wat 500 keer kleiner as 'n menslike sel is, ons doodmaak, of omgekeerd, ons lewe gee? Ek het my lewe lank gewonder hoe hierdie klein diertjies die vermoë gekry het om die lot van verregaande groter organismes te beheer. Wat wetenskaplikes bevind het, is dat bakterieë krag in getalle het en dat hulle gesofistikeerde kommunikasievermoëns het wat vroeër as onmoontlik beskou is vir sulke klein, "primitiewe" organismes. In hierdie narratief sal ek jou probeer oortuig dat bakterieë met mekaar kan "praat", dat hulle veeltalig is, dat hulle saam in gekoördineerde groepe optree en dat hierdie vermoëns bakterieë hul ontsagwekkende krag gee.

Bakterieë kommunikeer met mekaar—nie met woorde nie, maar met chemikalieë. Bakterieë stel hierdie chemiese molekules (genoem outo-induseerders) vry in hul omgewing en dan gebruik hulle die opbou van hierdie seinmolekules om 'n sensus van hul selgetalle te neem. Wanneer 'n kritieke aantal selle bereik word, erken die bakterieë dat hulle in 'n groep is en tree hulle op as 'n gekoördineerde span wat nuwe gedrag toon.

In die tydverloopfliek wat hier gewys word (Video 1), groei 'n spesifieke bakteriese spesie (gewoonlik see-bewoner) op 'n skottel in 'n laboratorium. Wanneer die bakteriële selle 'n kritieke getal bereik, begin hulle blou lig produseer, 'n proses wat "bioluminesensie" genoem word. Die vrystelling van chemiese molekules wat outo-induseerders genoem word (gewoonlik onsigbaar, maar in die spotprent uitgebeeld) veroorsaak dat die bakterieë ligproduksie aanskakel. Hierdie proses word "kworumwaarneming" genoem. In die Journey to Discovery sal ons leer hoe wetenskaplikes kworumwaarneming ontdek het en hoe hulle die outo-induseerders en hul interaksie "reseptore" wat hierdie verskynsel onderlê, ontbloot het.

Video 1 Bakterie-selgroei en kworumwaarneming. Tydverloopfliek dek 'n tydperk van 5 uur. Die gesigsveld is 0,2 millimeter. Die animasie beeld die produksie van outo-induktormolekules uit wat veroorsaak dat die bakterieë teen hoë digtheid bioluminescent word.

Kworumwaarneming laat bakterieë toe om gesamentlik take uit te voer wat onsuksesvol sou wees as 'n enkele bakterie alleen sou optree (Figuur 1). Benewens bioluminessensie wat in die fliek gewys word, beheer kworumwaarneming die produksie van gifstowwe wat noodsaaklik is vir bakterieë om siektes te veroorsaak. Kworumwaarneming beheer biofilmvorming. Biofilms is gemeenskappe van bakteriese selle wat aan oppervlaktes vasgeheg is en 'n oorheersende vorm van bakteriele lewe op Aarde. Biofilms help baie bakterieë om as patogene op te tree en siektes te veroorsaak. Biofilms is ook krities vir voordelige bakteriese gedrag soos simbiose sowel as in industriële toepassings, soos afvalwatersuiwering en bioremediëring. Kworumwaarneming beheer bevoegdheid, wat die proses is wat bakterieë in staat stel om DNS van ander selle te verkry. Bekwaamheid laat bakterieë toe om hul genome te diversifiseer en is skouspelagtig ontgin om bakterieë te kry om vreemde gene in die biotegnologiebedryf te huisves.

Figuur 1 Kworumwaarneming beheer baie bakteriese gedrag by lae en hoë seldigtheid.

Bakterieë gebruik veelvuldige kworumwaarnemende outo-induktors vir kommunikasie in komplekse omgewings wat uit baie bakteriese spesies bestaan, wat die normale situasie in jou ingewande, mond, vel en ander omgewings is. Hulle dekodeer hierdie chemiese mengsels om hulself van ander te onderskei en, ons dink, deur dit te doen, onderskei hulle vriend van potensiële vyand. Hierdie vermoë stel bakterieë in staat om spanne te vorm met die korrekte, hulpvaardige spanlede, en vermy om mislei te word deur vyandelike bakterieë in die buurt wat dalk probeer om voordeel uit hulle te trek. Om self van ander te ken, is deur die hele biologie deurslaggewend.

In die Kennisoorsig sal ek bespreek hoe kworumwaarneming werk deur 'n proses wat seintransduksie genoem word, wat veroorsaak word deur outo-induktormolekules wat aan reseptore (spesifieke detektorproteïene) bind, wat daarna daartoe lei dat groot getalle gene aangeskakel of afgeskakel word. Slegs deur eers deeglik te verstaan ​​hoe bakterieë kommunikeer en die soorte gedrag wat deur kworumwaarneming beheer word, kan wetenskaplikes slinkse maniere uitdink om aan die proses te peuter, en sodoende kworum-waarneming-manipulasie toepassings uitdink wat suksesvol sal wees. In die Grense-afdeling sal ek 'n paar voorbeelde verskaf van die maniere waarop wetenskaplikes hul begrip van kworumwaarneming gebruik om landbou te verbeter en siektes te beveg.

Ek hoop jy sal verder lees. My droom is dat hierdie teks jou sal laat voel asof jy oor my skouer kyk, oor die skouers van drie belangrike wetenskaplikes wat voor my gekom het, en oor die skouers van die nuutste generasie wetenskaplikes terwyl ons op avonture gaan. Ek hoop jy sal verstaan ​​en voel hoe ons gevoel het toe ons ons eksperimente gedoen het, ons resultate geïnterpreteer (en verkeerd geïnterpreteer het), verkeerde paaie bewandel het en ook suksesvolle paaie bewandel het, soos ons ons ontdekkings gemaak het wat wys dat bakterieë met elkeen kan "praat". ander.


Om ander te red, kan bakterieë selfvernietig wanneer hulle deur 'n virus besmet word

Wetenskaplikes het meer as honderd jaar gelede virusse bestudeer wat bakterieë infekteer en doodmaak, wat bakteriofage of fage genoem word as 'n terapeutiese middel vir bakteriële infeksies. Antibiotika het egter gekom en ons het hierdie virusse nie meer nodig gehad nie. Noudat antibiotika minder doeltreffend word, wil navorsers meer weet oor fage, en hoe dit gebruik kan word om bakteriële infeksies wat antibiotika-weerstandig is, te behandel. Wetenskaplikes het nou 'n immuunmeganisme geïdentifiseer wat bakterieë teen fage beskerm, en werk deur 'n selfvernietigingsmodus in bakterieë te begin en sodoende te verhoed dat die infeksie na ander selle versprei. Die bevindinge, wat implikasies het vir die gebruik van fage as 'n behandeling, is in Molecular Cell gerapporteer.

"Abortiewe infeksie is 'n ou konsep, maar dit is steeds omstrede - 'n bakteriese sel neem in wese een vir die span, wat homself doodmaak eerder as om gebruik te word om meer fage te produseer," het die senior studie skrywer Kevin Corbett, Ph.D., gesê. medeprofessor in sellulêre en molekulêre medisyne aan die Universiteit van Kalifornië San Diego Skool vir Geneeskunde.

"Daar is gedebatteer of dit logies is, vanuit 'n evolusionêre oogpunt, dat eensellige organismes dit doen. Maar as ons aan bakterieë dink as 'n samewerkende gemeenskap, 'n biofilm, eerder as as individuele selle, maak dit sin."

Corbett se laboratorium het gebruik om 'n seldelingsproses genaamd meiose te bestudeer. 'n Proteïenfamilie genaamd HORMA het 'n fokus van hul navorsing geword, en in 2015 het bioinformatika-data van die National Institutes of Health voorgestel dat bakterieë hierdie proteïene maak.

"Ek is 'n basiese wetenskaplike, en ek stel veral belang in evolusionêre verbande tussen proteïene en paaie wat jy nooit sou verwag om verwant te wees nie," het Corbett gesê. "So ek het gewonder, wat kan hierdie proteïene in bakterieë doen?"

Hierdie nuut-geïdentifiseerde bakteriese immuunstelsel, genaamd CBASS, kan gevind word in ongeveer tien persent van bakterieë uit die ongeveer 75 000 met genome wat in volgorde geplaas is, het Corbett gesê. Sy span het 'n laboratoriumstam van faag-sensitiewe Escherichia coli ontwerp om CBASS te dra. "Ons was verheug om te vind dat CBASS byna absolute immuniteit aan fage verskaf," het Corbett opgemerk.

Die navorsers het ook meer geleer oor die molekulêre kenmerke van die proteïene wat in CBASS funksioneer, die HORMA-proteïene voel infeksie en veroorsaak 'n ander proteïen om 'n boodskap te stuur. Hierdie boodskap aktiveer 'n ensiem wat die bakteriese genoom vernietig, wat die sel doodmaak en keer dat die faag voortplant.

Hierdie werk kan wetenskaplikes help om faagterapieë te skep wat ondeurdringbaar is vir CBASS, en meer effektief is om bakteriële infeksies te stop. Die video hierbo vertel die storie van 'n man wat deur fage gered is van 'n dwelm-weerstandige infeksie.

"Aan die ander kant, as ons 'n manier kan vind om hierdie stelsel met 'n dwelm te aktiveer, kan ons dalk CBASS-bevattende bakterieë kry om hulself dood te maak," het hy gesê. " Om so iets te doen, vereis regtig dat ons 'n duidelike begrip het van die gedetailleerde meganismes wat speel.

"Ons het net een van meer as 6 000 verskillende CBASS-stelsels bestudeer, wat elkeen 'n ander stel infeksiesensors kodeer, seinproteïene en effektorproteïene soos die nuklease in ons stelsel. Om te verstaan ​​hoe hierdie verskillende stelle dele saamwerk, en hoe bakterieë hulle vermeng en pas soos hulle ontwikkel het, sal ons 'n meer volledige prentjie gee van hoe dit alles werk, en hoe ons die beste kan ingryp."


Uitgestalte

Hoogtepunte

Vergeet van die stereotipe van bakterieë as eenvoudige lewensvorme, wat verstandeloos in 'n waterdruppel swem of vas aan badkamerdeurhandvatsels, en wag dat iemand hulle optel. "Bakterieë is glad nie eenvoudig nie," sê Guillaume Lambert, Toegepaste en Ingenieursfisika. “Hulle is eintlik uiters gesofistikeerd. Hulle bestaan ​​al miljarde jare, hulle het allerhande truuks om te oorleef.”

Lambert bestudeer die truuks wat bakterieë help om antibiotika te weerstaan. Namate die aantal bruikbare antibiotika steeds afneem, is hierdie weerstand 'n toenemende probleem vir mense, maar dit is besigheid soos gewoonlik vir bakterieë. "Bakterieë het deur hul geskiedenis weerstand ontwikkel - teen swamme, teen ander bakterieë," sê hy. "Daar was nog altyd 'n oorlog, maar ons mense het dit nou op die voorgrond gebring."

'n Nuwe tegniek vir die bestudering van bakterieselle in reële tyd

Lambert, 'n fisikus van opleiding, gebruik sy fisikus se gereedskapstel om biologiese vrae na te streef. Sy ondersoek na die meganismes van antibiotika-weerstandigheid het daartoe gelei dat hy 'n nuwe tegniek geskep het om bakterieë te bestudeer. Lambert se tegniek maak staat op mikrovervaardiging en mikrofluidika om individuele selle intyds te bestudeer soos hulle op hul omgewing reageer.

"Ons fokus op net 'n paar individue wat deel is van 'n groter bevolking," verduidelik hy. “In die geval van antibiotikaweerstand beteken dit ons kan identifiseer en waarneem hoe antibiotika sellulêre fisiologie beïnvloed. Dit is anders as die gewone toetse waar jy 'n proefbuis van bakterieë het en jy 'n antibiotika insit en al die selle sterf. Jy weet jy het ’n goeie antibiotika, maar jy weet nie wat dit eintlik aan die selle self doen nie.”

Die Lambert-laboratorium gebruik 'n toestel wat 'n moedermasjien genoem word, wat die navorsers in staat stel om selle in mikrofluïdiese kanale te beperk waar vloeiende groeimedia op mikrovlak beheer word. Soos 'n moedersel groei en verdeel, migreer sy dogterselle in die kanaal op en word uiteindelik in die media weggespoel, maar die oorspronklike moedersel bly altyd. Met ’n beeldmikroskoop kan Lambert en sy kollegas intyds die reaksies van die selle op veranderinge wat hulle in die omgewing veroorsaak, soos die byvoeging van ’n antibiotiese behandeling, opneem.

'n Aanhoudende oorlewende, 'n dormante bakteriese sel genaamd Persister

Hulle stel veral belang in 'n dormante bakteriese seltipe wat bekend staan ​​as 'n persistersel. "'n Bakterie in die aanhoudende toestand kan alle soorte omgewingstressors oorleef wat dit normaalweg sal doodmaak: antibiotika, PH-veranderinge, die galsoute wat ons in ons ingewande het, virusse genoem fage wat die selle infekteer," verduidelik Lambert. “Dit is ’n wonderlike oorlewingstrategie. As daar 'n antibiotiese behandeling is wat 99,99 persent van bakterieë doodmaak, en jy is daardie 0,01 persent wat dormant gegaan het, dan het jy die hele veld vir jouself wanneer jy 'n paar uur of 'n paar dae later wakker word.

“Bakterieë het deur hul geskiedenis weerstand ontwikkel—teen swamme, teen ander bakterieë. Daar was nog altyd ’n oorlog, maar ons mense het dit nou op die voorgrond gebring.”

Deur die bakterieë te versteur, verhoog die navorsers die kans op die vorming van persisterselle, wat dit makliker maak om te bestudeer. Dan behandel hulle die bakterieë met rondtes van 'n antibiotika wat die masjinerie van seldeling teiken, wat die bakterieë tyd gee om tussen elke rondte te herstel. "Met elke behandeling moet daar 'n 50 persent kans wees dat enige individuele sel sterf," sê Lambert. “Maar ons kan 'n paar selle vind wat nooit sterf nie. Die afkoms van hierdie selle is duidelik en spesiaal in vergelyking met die res van die bevolking. Omdat hulle oorleef het, weet ons hulle het iets reg gedoen. Deur hulle te ontleed, kan ons sien wat die res doodgemaak het deur te sien wat die oorlewendes fikser gemaak het.”

Die navorsers het ontdek dat hulle geneties identies is aan die ander selle wat die genome van persisterselle wat oorleef, in volgorde bepaal. "Deur sommige netwerkherrangskikkings wat ons begin verstaan, kan hulle hierdie dormante toestand binnegaan," sê Lambert. "Hulle het nie 'n mutasie nie, hulle het net 'n ander fenotipe." Hy en sy kollegas het ook gevind dat selderftesyfer van ouderdom afhang.

"As 'n sel ouer is, is dit meer geneig om te verdeel, en as dit verdeel met die teenwoordige antibiotika, sal die selwand skeur," verduidelik Lambert. "Maar selle wat jonger is of pas gedeel het, sal vir 'n rukkie nie verdeel nie, en daarom word hulle vir 'n tyd lank teen die antibiotika-effekte beskerm."

Skep sintetiese bakterieë om die liggaam van probleme te waarsku

In 'n ander lyn van navorsing ondersoek die Lambert-laboratorium ook sintetiese biologie, die ingenieurswese van organismes vir 'n spesifieke doel. "Die langtermyn visie is om bakterieë te neem en hulle 'n brein te gee," sê Lambert. "Hulle kan swem soos bakterieë en voel soos bakterieë en verdeel soos bakterieë, maar hulle kan ons ook waarsku, byvoorbeeld, wanneer daar 'n patogeen teenwoordig is in 'n pasiënt se liggaam of 'n giftige verbinding in die omgewing."

Om die sintetiese organismes te skep, plaas die navorsers stukke DNA van ander organismes soos swamme, fage of ander bakterieë in 'n bakterie. Om dit te doen, gebruik hulle CRISPR-Cas12, 'n proses wat die CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeats) DNA-volgorde en die nuklease Cas12 van bakterieë gebruik om gene in lewende modelle te wysig. Al die nuwe komponente saam skep iets soos 'n stroombaan. "Op die basiese vlak lyk dit alles baie soos fisika of elektronika," sê Lambert. "Die interaksie tussen die verskillende komponente is soortgelyk aan die logiese hekke wat jy in 'n rekenaar het."

Deur komponente op nuwe maniere te kombineer, hoop Lambert en sy kollegas om 'n nuwe funksie in bakterieë te skep wat vir mense nuttig kan wees. "In die toekoms kan jy probiotika hê wat in jou ingewande leef en as wagte optree," verduidelik Lambert. “Hulle kan wanbalanse in voedingstowwe of die teenwoordigheid van patogene opspoor en dan intyds reageer. Hulle kan byvoorbeeld rooi gloei in die teenwoordigheid van ’n patogeen, en jy sal gewaarsku word wanneer jy dit in jou stoelgang sien.”

Die sintetiese molekules kan ook eendag siektes behandel, stel Lambert voor. Hulle kan byvoorbeeld 'n antimikrobiese verbinding produseer as hulle infeksie opspoor. Hulle kan ook gebruik word om die omgewing te monitor, soos mere, waar hulle algeblomme kan aanval wanneer hulle dit waarneem.

Gebruik Fisika om Biologie te bestudeer

Lambert het sy universiteitswerk as 'n suiwer fisikus begin met geen belangstelling in biologie nie. "As 'n voorgraadse student het ek geweet van mikrovervaardiging en transistors," sê hy. “Maar op die nagraadse skool het een van my professore fisika gebruik om biologie te studeer. Ek het gedink: 'Dit is so gaaf. Ek wil dit doen. Ek wil my kennis op biologie toepas.’”

Nou, as professor, het hy minder tyd om in die laboratorium te peuter, maar die praktiese benadering roep hom steeds. "Elke af en toe gaan ek na die laboratorium en doen 'n paar vinnige eksperimente net om my gegrond te hou," sê hy. “As ek daar ingaan, vergeet ek van al die ander probleme wat ek kan hê. Ek raak nie vasgevang nie, en ek kan ’n breër visie hê.”


Virus en bakterieë

Virus – 'n Virus is 'n kapsule proteïen wat genetiese materiaal bevat. 'n Virus kan nie op sy eie voortplant nie, dit moet 'n lewende sel besmet om te groei.

Bakterieë – Bakterieë is eensellige organismes wat op hul eie leef. Hulle kan vermenigvuldig en reproduseer deur onderverdeling

Bakterieë en virusse veroorsaak baie van die siektes wat ons’re bekend met en kan sinoniem klink hulle is baie verskillend van mekaar.

Vir een ding, hulle verskil baie in grootte. Die grootste virusse is net so groot soos die kleinste bakterieë. Virusse is mikroskopies, hulle wissel in grootte van ongeveer 20 tot 400 nanometer in deursnee (1 nanometer = 10 -9 meter). Daarenteen is die kleinste bakterieë ongeveer 400 nanometer groot.

Nog 'n verskil is hul struktuur. Bakterieë is kompleks in vergelyking met virusse. 'n Tipiese bakterie het 'n rigiede selwand en 'n dun, rubberagtige selmembraan wat die vloeistof, of sitoplasma binne-in die sel, omring. ’n Bakterie bevat al die genetiese inligting wat nodig is om kopieë van homself te maak—sy DNA—in ’n struktuur wat ’n chromosoom genoem word. Daarbenewens kan dit ekstra los stukkies DNA hê wat plasmiede genoem word wat in die sitoplasma dryf. Bakterieë het ook ribosome, gereedskap wat nodig is om DNA te kopieer sodat bakterieë kan voortplant. Sommige het draadagtige strukture genoem flagella wat hulle gebruik om te beweeg.

'n Virus het dalk 'n buitenste stekelrige laag wat die koevert genoem word, al dan nie. Alle virusse het 'n proteïenbedekking en 'n kern van genetiese materiaal, hetsy DNA of RNA. En dit’s dit.

Die belangrikste verskil tussen virusse en bakterieë is die manier waarop hulle voortplant. Bakterieë, gegewe die regte voedingstowwe, kan op hul eie groei en reproduseer, maar… Virusse kan nie “lewe” of voortplant sonder om binne een of ander lewende sel te kom, of dit nou 'n plant, dier of bakterieë is.

Virale vs. Bakteriële Voortplanting

Bakterieë bevat die genetiese bloudruk (DNS) en al die gereedskap (ribosome, proteïene, ens.) wat hulle nodig het om hulself voort te plant.

Virusse is moochers. Hulle bevat slegs 'n beperkte genetiese bloudruk en hulle het’t het die nodige bou gereedskap. Hulle moet ander selle binneval en hul sellulêre masjinerie kaap om voort te plant. Virusse dring binne deur aan 'n sel te heg en hul gene in te spuit of deur die sel in te sluk. Hier’s 'n voorbeeld van virale infeksie.

Dit is T4-bakteriofage. Hulle is 'n soort virus wat bakterieë besmet. Hier land hulle op die oppervlak van 'n E coli bakterie. Die bakteriofaag sny 'n gat in die E. coli’s selwand. Dit spuit dan sy genetiese materiaal in die bakterie. Deur die oor te neem E. coli’s genetiese masjinerie, vertel die virale gene die bakterie om nuwe virusdele te begin maak. Hierdie dele kom bymekaar om heel nuwe virusse binne die bakterie te maak. Uiteindelik word soveel nuwe virusse gemaak dat die E coli bars oop en sterf, wat al daardie nuwe virusse vrystel om meer selle te besmet!


Hoe word bakteriële infeksies behandel?

Die meeste bakteriële infeksies kan effektief met antibiotika behandel word. Hulle maak óf bakterieë dood óf keer dat hulle vermeerder. Dit help die liggaam se immuunstelsel om die bakterieë te beveg.

Jou dokter se keuse van antibiotika sal afhang van die bakterieë wat die infeksie veroorsaak. Antibiotika wat teen 'n wye reeks bakterieë werk, word breëspektrum antibiotika genoem.

Antibiotiese weerstand is 'n groeiende probleem, so antibiotika mag slegs vir ernstige bakteriële infeksies voorgeskryf word.


Verwysings

Hooi, J. K. et al. Wêreldwye voorkoms van Helicobacter pylori infeksie: sistematiese oorsig en meta-analise. Gastroënterologie 153, 420–429 (2017).

Yamaoka, Y. Hoe om maagkanker-verwante dood wêreldwyd uit te skakel? Nat. Ds Clin. Oncol. 15, 407–408 (2018).

Sugano, K. et al. Kyoto globale konsensusverslag oor Helicobacter pylori gastritis. Darm 64, 1353–1367 (2015).

Shiotani, A., Lu, H., Dore, M. P. & Graham, D. Y. Treating Helicobacter pylori effektief terwyl die misbruik van antibiotika tot die minimum beperk word. Cleve. Clin. J. Med. 84, 310 (2017).

Graham D. Y. in Helicobacter pylori (reds Hunt, R. H. & Tytgat, G. N. J.) 531-537 (Springer, 1994).

Malfertheiner, P. et al. Bestuur van Helicobacter pylori infeksie — die Maastricht V/Florence konsensusverslag. Darm 66, 6–30 (2017).

Thung, I. et al. Oorsigartikel: die wêreldwye opkoms van Helicobacter pylori antibiotika weerstand. Voeding. Pharmacol. Daar. 43, 514–533 (2016).

Kasahun, G. G., Demoz, G. T. & Desta, D. M. Primêre weerstandspatroon van Helicobacter pylori vir antibiotika in volwasse bevolking: 'n sistematiese oorsig. Infekteer. Dwelm. Weerstand 13, 1567–1573 (2020).

De Francesco, V. et al. Wêreldwyd H. pylori Antibiotiese weerstand: 'n sistematiese oorsig. J. Gastrointest. Lewer Dis. 19, 409–414 (2010).

Savoldi, A., Carrara, E., Graham, D. Y., Conti, M. & Tacconelli, E. Voorkoms van antibiotika weerstand in Helicobacter pylori: 'n sistematiese oorsig en meta-analise in streke van die Wêreldgesondheidsorganisasie. Gastroënterologie 155, 1372–1382.e17 (2018).

Li, B.-Z. et al. Vergelykende doeltreffendheid en verdraagsaamheid van behandelings vir Helicobacter pylori: sistematiese oorsig en netwerk meta-analise. BMJ 351, h4052 (2015).

Hu, Y., Zhu, Y. & Lu, N.-H. Nuwe en effektiewe terapeutiese regimes vir Helicobacter pylori in 'n era van toenemende antibiotika weerstand. Voorkant. Sel. Infekteer. Mikrobiol. 7, 168 (2017).

Fallone, C. A., Moss, S. F. & Malfertheiner, P. Reconciliation of onlangse Helicobacter pylori behandelingsriglyne in 'n tyd van toenemende weerstand teen antibiotika. Gastroënterologie 157, 44–53 (2019).

Tacconelli, E. et al. Ontdekking, navorsing en ontwikkeling van nuwe antibiotika: die WGO-prioriteitlys van antibiotika-weerstandige bakterieë en tuberkulose. Lancet Infect. Dis. 18, 318–327 (2018).

Tuan, V.P. et al. 'n Volgende-generasie volgorde-gebaseerde benadering om genetiese determinante van antibiotika weerstand in Kambodjas te identifiseer Helicobacter pylori kliniese isolate. J. Clin. Med. 8, 858 (2019).

Lauener, F. N. et al. Genetiese determinante en voorspelling van antibiotiese weerstandfenotipes in Helicobacter pylori. J. Clin. Med. 8, 53 (2019).

Yonezawa, H., Osaki, T. & Kamiya, S. Biofilmvorming deur Helicobacter pylori en die betrokkenheid daarvan vir antibiotika-weerstandigheid. Biomed Res. Int. 2015, 914791 (2015).

Zhang, Z., Liu, Z.-Q., Zheng, P.-Y., Tang, F.-A. & Yang, P.-C. Invloed van uitvloeipompinhibeerders op die multigeneesmiddelweerstand van Helicobacter pylori. Wêreld J. Gastroenterol. 16, 1279 (2010).

Gong, Y. & amp Yuan, Y. Weerstand meganismes van Helicobacter pylori en sy dubbele teiken presiese terapie. Krit. Ds Microbiol. 44, 371–392 (2018).

Tshibangu-Kabamba, E. et al. Volgende-generasie volgordebepaling van die hele bakteriese genoom vir die dop van molekulêre insig in die breëspektrum antimikrobiese weerstand van Helicobacter pylori kliniese isolate van die Demokratiese Republiek van die Kongo. Mikro-organismes 8, 887 (2020).

Binh, T.T. et al. Ontdekking van nuwe mutasies vir klaritromisienweerstand in Helicobacter pylori deur volgende generasie volgordebepaling te gebruik. J. Antimikrob. Chemother. 69, 1796–1803 (2014).

Gerrits, M. et al. Veranderinge in penisillien-bindende proteïen 1A verleen weerstand teen β-laktam antibiotika in Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 46, 2229–2233 (2002).

Nakamura, M. et al. Maagsap, maagweefsel en bloed antibiotika konsentrasies na omeprazole, amoksisillien en klaritromisien drievoudige terapie. Helicobacter 8, 294–299 (2003).

Fallone, C. A. et al. Die Toronto-konsensus vir die behandeling van Helicobacter pylori infeksie by volwassenes. Gastroënterologie 151, 51–69.e14 (2016).

Grayson, M., Eliopoulos, G., Ferraro, M. & Moellering, R. Effek van variërende pH op die vatbaarheid van Campylobacter pylori aan antimikrobiese middels. EUR. J. Clin. Mikrobiol. Infekteer. Dis. 8, 888–889 (1989).

Zullo, A. Die huidige rol van dubbele terapie vir behandeling van Helicobacter pylori: terug na die toekoms? EUR. J. Gastroenterol. Hepatol. 32, 555–556 (2020).

Suarez, C. & Gudiol, F. Beta-laktam antibiotika [Spaans]. Enferm. Infecc. Mikrobiol. Clin. 27, 116–129 (2009).

Livermore, D.M. beta-laktamases in laboratorium en kliniese weerstand. Clin. Mikrobiol. Ds. 8, 557–584 (1995).

Gerrits, M. M. et al. Veelvuldige mutasies in of aangrensend aan die bewaarde penisillien-bindende proteïenmotiewe van die penisillienbindende proteïen 1A verleen amoksisillienweerstand teen Helicobacter pylori. Helicobacter 11, 181–187 (2006).

Okamoto, T. et al. 'n Verandering in PBP1 is betrokke by amoksisillienweerstand van kliniese isolate van Helicobacter pylori. J. Antimikrob. Chemother. 50, 849–856 (2002).

Rimbara, E., Noguchi, N., Kawai, T. & Sasatsu, M. Mutasies in penisillienbindende proteïene 1, 2 en 3 is verantwoordelik vir amoksisillienweerstand in Helicobacter pylori. J. Antimikrob. Chemother. 61, 995–998 (2008).

Hu, Y., Zhang, M., Lu, B. & Dai, J. Helicobacter pylori en antibiotika weerstand, 'n voortdurende en onoplosbare probleem. Helicobacter 21, 349–363 (2016).

Kwon, D.H. et al. Hoëvlak β-laktamweerstand geassosieer met verworwe multigeneesmiddelweerstand in Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 47, 2169–2178 (2003).

DeLoney, C. R. & Schiller, N. L. Karakterisering van 'n in vitro-geselekteerde amoksisillien-weerstandige stam van Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 44, 3368–3373 (2000).

Dore, M. P. et al. Amoksisillientoleransie in Helicobacter pylori. J. Antimikrob. Chemother. 43, 47–54 (1999).

Drusano, G. et al. Farmakokinetika en farmakodinamika van fluorokinolone. Clin. Mikrobiol. Infekteer. 4, 2S27–2S41 (1998).

Correia, S., Poeta, P., Hébraud, M., Capelo, J. L. & Igrejas, G. Meganismes van kinoloonwerking en weerstand: waar staan ​​ons? J. Med. Mikrobiol. 66, 551–559 (2017).

Aldred, K. J., Kerns, R. J. & Osheroff, N. Meganisme van kinoloonwerking en weerstand. Biochemie 53, 1565–1574 (2014).

Moore, R. A., Beckthold, B., Wong, S., Kureishi, A. & Bryan, L. E. Nukleotiedvolgorde van die gyrA-geen en karakterisering van ciprofloxacin-weerstandige mutante van Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 39, 107–111 (1995).

Mori, H., Suzuki, H., Matsuzaki, J., Masaoka, T. & Kanai, T.Verkryging van dubbele mutasie in gyrA het hoë weerstand teen sitafloxacin in Helicobacter pylori na onsuksesvolle uitwissing met sitafloxacin-bevattende regimes. Verenigde Europese Gastroenterol. J. 6, 391–397 (2018).

Miyachi, H. et al. Primêre levofloksasienweerstand en gyrA/B-mutasies onder Helicobacter pylori Japan. Helicobacter 11, 243–249 (2006).

Rodvold, K.A. Kliniese farmakokinetika van klaritromisien. Clin. farmakokinet. 37, 385–398 (1999).

Erah, P., Goddard, A., Barrett, D., Shaw, P. & Spiller, R. Die stabiliteit van amoksisillien, klaritromisien en metronidasool in maagsap: relevansie vir die behandeling van Helicobacter pylori infeksie. J. Antimikrob. Chemother. 39, 5–12 (1997).

Gaynor, M. & Mankin, A. S. Makrolide-antibiotika: bindingsplek, meganisme van werking, weerstand. Curr. Top. Med. Chem. 3, 949–960 (2003).

Versalovic, J. et al. Mutasies in 23S rRNA word geassosieer met klaritromisienweerstand in Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 40, 477–480 (1996).

Hao, Q., Li, Y., Zhang, Z.-J., Liu, Y. & Gao, H. Nuwe mutasiepunte in 23S rRNA geen wat verband hou met Helicobacter pylori weerstand teen klaritromisien in die noordooste van China. Wêreld J. Gastroenterol. 10, 1075 (2004).

Debets-Ossenkopp, Y., Namavar, F. & MacLaren, D. Effek van 'n suur omgewing op die vatbaarheid van Helicobacter pylori na trospektomisien en ander antimikrobiese middels. EUR. J. Clin. Mikrobiol. Infekteer. Dis. 14, 353–355 (1995).

Dingsdag, S. A. & Hunter, N. Metronidazole: 'n opdatering oor metabolisme, struktuur-sitotoksisiteit en weerstandsmeganismes. J. Antimikrob. Chemother. 73, 265–279 (2018).

Hoffman, P. S., Goodwin, A., Johnsen, J., Magee, K. & van Zanten, S. V. Metaboliese aktiwiteite van metronidasool-sensitiewe en -weerstandige stamme van Helicobacter pylori: onderdrukking van piruvaatoksidoreduktase en uitdrukking van isocitraat liase aktiwiteit korreleer met weerstand. J. Bakteriol. 178, 4822–4829 (1996).

Kwon, D.-H. et al. Ontleding van RdxA en betrokkenheid van addisionele gene wat kodeer vir NAD(P)H flavinoksidoreduktase (FrxA) en ferredoksienagtige proteïen (FdxB) in metronidasoolweerstand van Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 44, 2133–2142 (2000).

Kwon, D. H., Kato, M., El-Zaatari, F. A., Osato, M. S. & Graham, D. Y. Raamverskuiwingmutasies in NAD(P)H-flavienoksidoreduktase-koderende geen (FrxA) vanaf metronidasool-weerstandige Helicobacter pylori ATCC43504 en sy betrokkenheid by metronidasoolweerstand. FEMS Microbiol. Lett. 188, 197–202 (2000).

Martínez-Júlvez, M. et al. Struktuur van RdxA - 'n suurstof-onsensitiewe nitroreduktase wat noodsaaklik is vir metronidasool-aktivering in Helicobacter pylori. FEBS J. 279, 4306–4317 (2012).

Goodwin, A. et al. Metronidasool weerstand in Helicobacter pylori is te wyte aan nulmutasies in 'n geen (RdxA) wat 'n suurstof-onsensitiewe NADPH nitroreduktase kodeer. Mol. Mikrobiol. 28, 383–393 (1998).

Sisson, G. et al. Metronidasool-aktivering is mutageen en veroorsaak DNA-fragmentasie in Helicobacter pylori en in Escherichia coli wat 'n gekloonde bevat H. pylori RdxA + (nitroreduktase) geen. J. Bakteriol. 182, 5091–5096 (2000).

Jeong, J.-Y. et al. Opeenvolgende inaktivering van RdxA (HP0954) en FrxA (HP0642) nitroreduktase gene veroorsaak matige en hoë vlak metronidasool weerstand in Helicobacter pylori. J. Bakteriol. 182, 5082–5090 (2000).

Albert, T. J. et al. Mutasie-ontdekking in bakteriese genome: metronidasoolweerstand in Helicobacter pylori. Nat. Metodes 2, 951–953 (2005).

Smith, M. A. & Edwards, D. I. Suurstofopruiming, NADH-oksidase en metronidasoolweerstand in Helicobacter pylori. J. Antimikrob. Chemother. 39, 347–353 (1997).

Choi, S. S., Chivers, P. T. & Berg, D. E. Puntmutasies in Helicobacter pylorise pels regulatoriese geen wat weerstand teen metronidasool verander, 'n progeneesmiddel wat deur chemiese reduksie geaktiveer word. PLoS EEN 6, e18236 (2011).

Chang, K.-C., Ho, S.-W., Yang, J.-C. & Wang, J.-T. Isolasie van 'n genetiese lokus wat verband hou met metronidasool weerstand in Helicobacter pylori. Biochem. Biofis. Res. Commun. 236, 785–788 (1997).

Thompson, S. A. & Blaser, M. J. Isolasie van die Helicobacter pylori recA geen en betrokkenheid van die recA streek in weerstand teen lae pH. Infekteer. Immuniteit. 63, 2185–2193 (1995).

Tsugawa, H. et al. Verbeterde bakteriese uitvloeistelsel is die eerste stap na die ontwikkeling van metronidasoolweerstand in Helicobacter pylori. Biochem. biofis. Res. Commun. 404, 656–660 (2011).

Tsugawa, H. et al. Twee aminosure mutasie van ferri opname reguleerder bepaal Helicobacter pylori weerstand teen metronidasool. Antioksidasie. Redoks sein. 14, 15–23 (2011).

Tsugawa, H., Suzuki, H., Matsuzaki, J., Hirata, K. & Hibi, T. FecA1, 'n bakteriese ystervervoerder, bepaal die oorlewing van Helicobacter pylori in die maag. Vrye Radik. Biol. Med. 52, 1003–1010 (2012).

Lacey, S., Moss, S. & Taylor, G. Metronidasool opname deur sensitiewe en weerstandbiedende isolate van Helicobacter pylori. J. Antimikrob. Chemother. 32, 393–400 (1993).

Moore, R. A., Beckthold, B. & Bryan, L. Metronidasool opname in Helicobacter pylori. Kan. J. Microbiol. 41, 746–749 (1995).

Graham, D. Y. Antibiotiese weerstand in Helicobacter pylori: implikasies vir terapie. Gastroënterologie 115, 1272–1277 (1998).

Chopra, I. & Roberts, M. Tetracycline-antibiotika: werkingswyse, toepassings, molekulêre biologie en epidemiologie van bakteriese weerstand. Mikrobiol. Mol. Biol. Ds. 65, 232–260 (2001).

Ross, J. I., Eady, E. A., Cove, J. H. & Cunliffe, W. J. 16S rRNA mutasie wat verband hou met tetrasiklien weerstand in 'n gram-positiewe bakterie. Antimikrobiese. Agente Chemother. 42, 1702–1705 (1998).

Dailidiene, D. et al. Opkoms van tetrasiklienweerstand in Helicobacter pylori: veelvuldige mutasieveranderinge in 16S ribosomale DNA en ander genetiese lokusse. Antimikrobiese. Agente Chemother. 46, 3940–3946 (2002).

Gerrits, M. M., de Zoete, M. R., Arents, N. L., Kuipers, E. J. & Kusters, J. G. 16S rRNA-mutasie-gemedieerde tetrasiklienweerstand in Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 46, 2996–3000 (2002).

Wu, J.Y. et al. Tetrasiklien-weerstandige kliniese Helicobacter pylori isolate met en sonder mutasies in 16S rRNA-koderende gene. Antimikrobiese. Agente Chemother. 49, 578–583 (2005).

Aristoff, P. A., Garcia, G. A., Kirchhoff, P. D. & Showalter, H. H. Rifamycins – struikelblokke en geleenthede. Tuberkulose 90, 94–118 (2010).

Finch, C. K., Chrisman, C. R., Baciewicz, A. M. & Self, T. H. Rifampin en rifabutin dwelm interaksies: 'n opdatering. Boog. Intern. Med. 162, 985–992 (2002).

Mori, H. et al. Rifabutien-gebaseerde 10-dae en 14-dae drievoudige terapie as 'n derde- en vierde-lyn regime vir Helicobacter pylori uitwissing: 'n loodsstudie. Verenigde Europese Gastroenterol. J. 4, 380–387 (2016).

Gisbert, J. P. & Pajares, J. M. Helicobacter pylori "redding"-terapie na mislukking van twee uitroeiingsbehandelings. Helicobacter 10, 363–372 (2005).

Nishizawa, T. et al. Helicobacter pylori weerstand teen rifabutien in die afgelope 7 jaar. Antimikrobiese. Agente Chemother. 55, 5374–5375 (2011).

Kunin, C. M. Antimikrobiese aktiwiteit van rifabutien. Clin. Infekteer. Dis. 22, S3–S14 (1996).

Heep, M., Beck, D., Bayerdörffer, E. & Lehn, N. Rifampin en rifabutin weerstand meganisme in Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 43, 1497–1499 (1999).

Heep, M., Rieger, U., Beck, D. & Lehn, N. Mutasies in die begin van die rpoBGene kan weerstand teen rifamisiene in beide veroorsaak Helicobacter pylori en Mycobacterium tuberculosis. Antimikrobiese. Agente Chemother. 44, 1075–1077 (2000).

Mori, H., Suzuki, H., Matsuzaki, J., Masaoka, T. & Kanai, T. 10-jaar-tendense in Helicobacter pylori-uitwissingsyfers deur sitafloxacin-gebaseerde derdelyn-reddingsterapie. Spysvertering 101, 644–650 (2019).

Siavoshi, F., Saniee, P. & Malekzadeh, R. Effektiewe antimikrobiese aktiwiteit van rifabutien teen multi-middel-weerstandige Helicobacter pylori. Helicobacter 23, e12531 (2018).

Chey, W. D., Leontiadis, G. I., Howden, C. W. & Moss, S. F. ACG Kliniese Riglyn: behandeling van Helicobacter pylori infeksie. Am. J. Gastroenterol. 112, 212–239 (2017).

Sisson, G. et al. Ensieme wat verband hou met reduktiewe aktivering en werking van nitazoxanied, nitrofurane en metronidasool in Helicobacter pylori. Antimikrobiese middels chemoterapie 46, 2116–2123 (2002).

Su, Z. et al. Mutasies in Helicobacter pylori porD- en oorD-gene kan bydra tot furasolidoonweerstand. Kroaties Med. J. 47, 410–415 (2006).

Buzás, G. M. & Józan, J. Nitrofuran-gebaseerde regimes vir die uitwissing van Helicobacter pylori infeksie. J. Gastroenterol. Hepatol. 22, 1571–1581 (2007).

Shao, Y. et al. Antibiotiese weerstand van Helicobacter pylori tot 16 antibiotika by kliniese pasiënte. J. Clin. Lab. Anaal. 32, e22339 (2018).

Moghaddam, A.B. et al. Sensitiwiteit vir nitazoxanied onder metronidasoolbestande Helicobacter pylori stamme by pasiënte met gastritis. Med. J. Islamitiese Republiek. Iran. 30, 405 (2016).

Lee, S., Sneed, G. T. & Brown, J. N. Behandeling van Helicobacter pylori met nitazoxanied-bevattende regimes: 'n sistematiese oorsig. Infekteer. Dis. 52, 381–390 (2020).

Ji, C.-R. et al. Veiligheid van furazolidon-bevattende regimen in Helicobacter pylori infeksie: 'n sistematiese oorsig en meta-analise. BMJ oop. 10, e037375 (2020).

Zhuge, L. et al. Furazolidon behandeling vir Helicobacter pylori infeksie: 'n sistematiese oorsig en meta-analise. Helicobacter 23, e12468 (2018).

Graham, D. Y. & Lu, H. Furazolidone in Helicobacter pylori terapie: misverstaan ​​en dikwels onregverdig verguisde dwelm vertel in 'n storie van Franse brood. Saudi J. Gastroenterol. 18, 1–2 (2012).

EFSA-paneel oor kontaminante in die voedselketting (CONTAM). Wetenskaplike mening oor nitrofurane en hul metaboliete in voedsel. EFSA J. 13, 4140 (2015).

Internasionale Agentskap vir Navorsing oor Kanker (IARC). IARC-monografieë oor die identifikasie van karsinogene gevare vir mense. (Wêreldgesondheidsorganisasie, 2019).

Zullo, A., Ierardi, E., Hassan, C. & De Francesco, V. Furazolidone-gebaseerde terapieë vir Helicobacter pylori infeksie: 'n saamgevoegde data-analise. Saudi J. Gastroenterol. 18, 11–17 (2012).

Boyanova, L., Hadzhiyski, P., Kandilarov, N., Markovska, R. & amp Mitov, I. Multidrug weerstand in Helicobacter pylori: huidige toestand en toekomstige rigtings. Deskundige Ds Clin. Pharmacol. 12, 909–915 (2019).

Hirata, K. et al. Bydrae van uitvloeipompe tot klaritromisienweerstand in Helicobacter pylori. J. Gastroenterol. Hepatol. 25, S75–S79 (2010).

Ge, X. et al. Bifunksionele ensiem SpoT is betrokke by biofilmvorming van Helicobacter pylori met multigeneesmiddelweerstand deur uitvloeipomp Hp1174 (gluP) op te reguleer. Antimikrobiese. Agente Chemother. 62, e00957-18 (2018).

Bos, M. P., Tefsen, B., Geurtsen, J. & Tommassen, J. Identifikasie van 'n buitenste membraanproteïen wat benodig word vir die vervoer van lipopolisakkaried na die bakteriese seloppervlak. Proc. Natl Acad. Wetenskap. 101, 9417–9422 (2004).

Stark, R. et al. Biofilm vorming deur Helicobacter pylori. Lett. Appl. Mikrobiol. 28, 121–126 (1999).

Cole, S. P., Harwood, J., Lee, R., She, R. & Guiney, D. G. Karakterisering van monospesie-biofilmvorming deur Helicobacter pylori. J. Bakteriol. 186, 3124–3132 (2004).

Carron, M. A., Tran, V. R., Sugawa, C. & Coticchia, J. M. Identifikasie van Helicobacter pylori biofilms in menslike maagslymvlies. J. Gastrointest. Surg. 10, 712–717 (2006).

Yonezawa, H. et al. Assessering van in vitro biofilmvorming deur Helicobacter pylori. J. Gastroenterol. Hepatol. 25, S90–S94 (2010).

Cellini, L. et al. Dinamiese kolonisasie van Helicobacter pylori in menslike maagslymvlies. Scand. J. Gastroenterol. 43, 178–185 (2008).

Greene, C., Vadlamudi, G., Newton, D., Foxman, B. & Xi, C. Die invloed van biofilmvorming en multigeneesmiddelweerstand op omgewingsoorlewing van kliniese en omgewingsisolate van Acinetobacter baumannii. Am. J. Infekteer. Beheer. 44, e65–e71 (2016).

Madsen, J. S., Burmølle, M., Hansen, L. H. & Sørensen, S. J. Die interkonneksie tussen biofilmvorming en horisontale geenoordrag. FEMS Immunol. Med. Mikrobiol. 65, 183–195 (2012).

Burmølle, M. et al. Verbeterde biofilmvorming en verhoogde weerstand teen antimikrobiese middels en bakteriële indringing word veroorsaak deur sinergistiese interaksies in multispesie biofilms. Appl. Omgewing. Mikrobiol. 72, 3916–3923 (2006).

Huang, J. Y., Goers Sweeney, E., Guillemin, K. & Amieva, M. R. Meervoudige suursensors beheer Helicobacter pylori kolonisasie van die maag. PLoS Pathog. 13, e1006118 (2017).

Mackay, W., Gribbon, L., Barer, M. & Reid, D. Biofilms in drinkwater systems: a possible reservoir for Helicobacter pylori. J. Appl. Mikrobiol. 85, 52S–59S (1998).

Berry, V., Jennings, K. & Woodnutt, G. Bakteriedodende en morfologiese effekte van amoksisillien op Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 39, 1859–1861 (1995).

Bode, G., Mauch, F. & Malfertheiner, P. The coccoid forms of Helicobacter pylori. Kriteria vir hul lewensvatbaarheid. Epidemiol. Infekteer. 111, 483–490 (1993).

Sarem, M. & Corti, R. Rol van Helicobacter pylori kokoïed vorm in infeksie en hergroei. Gastroenterol. Hepatol. 39, 28–35 (2016).

Kadkhodaei, S., Siavoshi, F. & Akbari Noghabi, K. Mucoid and coccoid Helicobacter pylori met vinnige groei en antibiotika weerstand. Helicobacter 25, e12678 (2020).

Hathroubi, S., Servetas, S.L., Windham, I., Merrell, D.S. & Ottemann, K.M. Helicobacter pylori biofilmvorming en die potensiële rol daarvan in patogenese. Mikrobiol. Mol. Biol. Ds. 82, e00001-18 (2018).

Andersson, D. I., Nicoloff, H. & Hjort, K. Meganismes en kliniese relevansie van bakteriële heteroreweerstand. Nat. Ds Microbiol. 17, 479–496 (2019).

Falagas, M., Makris, G., Dimopoulos, G. & Matthaiou, D. Heteroresistance: a concern of toenemende kliniese betekenis? Clin. Mikrobiol. Infekteer. 14, 101–104 (2008).

Li, J. et al. Heteroreweerstand teen kolistien in multi-middel-weerstandige Acinetobacter baumannii. Antimikrobiese. Agente Chemother. 50, 2946–2950 (2006).

Ailloud, F. et al. Binne-gasheer evolusie van Helicobacter pylori gevorm deur nis-spesifieke aanpassing, intragastriese migrasies en selektiewe vee. Nat. Commun. 10, 1–13 (2019).

Sun, L. et al. Druppel digitale PCR-gebaseerde opsporing van klaritromisienweerstand in Helicobacter pylori isolate openbaar gereelde heteroreweerstand. J. Clin. Mikrobiol. 56, e00019-18 (2018).

Kocsmár, É. et al. Helicobacter pylori heteroreweerstand teen klaritromisien by volwassenes - Nuwe data deur in situ opsporing en verbeterde konsep. Helicobacter 25, e12670 (2020).

Kao, C.-Y. et al. Heteroreweerstand van Helicobacter pylori van dieselfde pasiënt voor behandeling met antibiotika. Infekteer. Genet. Evol. 23, 196–202 (2014).

Hamidi, S. et al. Antibiotiese weerstand en klonale verwantskap van Helicobacter pylori stamme geïsoleer uit maagbiopsie monsters in noordoos van Iran. Helicobacter 25, e12684 (2020).

Rizvanov, A., Haertlé, T., Bogomolnaya, L. & Talebi Bezmin Abadi, A. Helicobacter pylori en die antibiotiese heteroreweerstand: 'n verwaarloosde kwessie in gepubliseerde riglyne. Voorkant. Mikrobiol. 10, 1796 (2019).

Arévalo-Jaimes, B. V. et al. Genotipiese bepaling van weerstand en heteroreweerstand teen klaritromisien in Helicobacter pylori isolate van antrum en korpus van Colombiaanse simptomatiese pasiënte. BMC besmet. Dis. 19, 546 (2019).

Matteo, M. J., Granados, G., Olmos, M., Wonaga, A. & Catalano, M. Helicobacter pylori amoksisillien heteroreweerstand as gevolg van puntmutasies in PBP-1A in isogeniese isolate. J. Antimikrob. Chemother. 61, 474–477 (2008).

Alebouyeh, M. et al. Impak van H. pylori gemengde infeksie en heteroreweerstand op kliniese uitkomste. Gastroenterol. Hepatol. Bed Bank 8, S1–S5 (2015).

Kim, J. J., Kim, J. G. & Kwon, D. H. Gemengde infeksie van antibiotika vatbaar en weerstandbiedend Helicobacter pylori isolate in 'n enkele pasiënt en onderskatting van antimikrobiese vatbaarheidstoetsing. Helicobacter 8, 202–206 (2003).

Farzi, N. et al. Karakterisering van klaritromisien heteroreweerstand onder Helicobacter pylori stamme wat uit die antrum en korpus van die maag geïsoleer is. Folia Microbiol. 64, 143–151 (2019).

Dore, M. P., Leandro, G., Realdi, G., Sepulveda, A. R. & Graham, D. Y. Effek van voorbehandeling antibiotika weerstand teen metronidasool en klaritromisien op die uitkoms van Helicobacter pylori terapie. Grawe. Dis. Wetenskap. 45, 68–76 (2000).

Fischbach, L. & Evans, E. L. Meta-analise: die effek van antibiotika weerstandstatus op die doeltreffendheid van drie- en viervoudige eerste-lyn terapieë vir Helicobacter pylori. Voeding. Pharmacol. Daar. 26, 343–357 (2007).

Gisbert, J. P. & Calvet, X. Opdatering oor nie-bismut viervoudige (gepaardgaande) terapie vir die uitwissing van Helicobacter pylori. Clin. Exp. Gastroenterol. 5, 23 (2012).

Greenberg, E. R. et al. 14-dae drievoudige, 5-dae gepaardgaande en 10-dae opeenvolgende terapieë vir Helicobacter pylori infeksie in sewe Latyns-Amerikaanse webwerwe: 'n gerandomiseerde proef. Lancet 378, 507–514 (2011).

Luther, J. et al. Empiriese quadruple vs triple terapie vir primêre behandeling van Helicobacter pylori infeksie: sistematiese oorsig en meta-analise van doeltreffendheid en verdraagsaamheid. Am. J. Gastroenterol. 105, 65–73 (2010).

Zou, Y. et al. Die effek van antibiotika weerstand op Helicobacter pylori uitwissing doeltreffendheid: 'n sistematiese oorsig en meta-analise. Helicobacter 25, e12714 (2020).

Malfertheiner, P. et al. Helicobacter pylori uitwissing met 'n kapsule wat bismutsubsitraat kalium, metronidasool en tetrasiklien bevat, gegee saam met omeprazol versus klaritromisien-gebaseerde drievoudige terapie: 'n gerandomiseerde, oop-etiket, nie-minderwaardige, fase 3-proef. Lancet 377, 905–913 (2011).

Smith, S. M., O'Morain, C. & McNamara, D. Antimikrobiese vatbaarheidstoetsing vir Helicobacter pylori in tye van toenemende antibiotika weerstand. Wêreld J. Gastroenterol. 20, 9912 (2014).

Mégraud, F. & Lehours, P. Helicobacter pylori opsporing en antimikrobiese vatbaarheidstoetsing. Clin. Mikrobiol. Ds. 20, 280–322 (2007).

Debets-Ossenkopp, Y., Brinkman, A., Kuipers, E., Vandenbroucke-Grauls, C. & Kusters, J. Verduideliking van die vooroordeel in die 23S rRNA geenmutasies wat verband hou met klaritromisienweerstand in kliniese isolate van Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 42, 2749–2751 (1998).

Dore, M. P. et al. Amoksisillienweerstand is een rede vir die mislukking van amoksisillien-omeprasool behandeling van Helicobacter pylori infeksie. Voeding. Pharmacol. daar. 12, 635–639 (1998).

Ecclissato, C. et al. Verhoogde primêre weerstand teen aanbevole antibiotika beïnvloed negatief Helicobacter pylori uitwissing. Helicobacter 7, 53–59 (2002).

Trieber, C.A. & Taylor, D.E. Mutasies in die 16S rRNA-gene van Helicobacter pylori bemiddel weerstand teen tetrasiklien. J. Bakteriol. 184, 2131–2140 (2002).

Realdi, G. et al.Voorbehandeling antibiotika weerstand in Helicobacter pylori infeksie: resultate van drie gerandomiseerde gekontroleerde studies. Helicobacter 4, 106–112 (1999).

Nishizawa, T. et al. Verbetering van amoksisillienweerstand na onsuksesvol Helicobacter pylori uitwissing. Antimikrobiese. Agente Chemother. 55, 3012–3014 (2011).

Graham, D. Y., Lee, Y. C. & Wu, M. S. Rational Helicobacter pylori terapie: bewysgebaseerde medisyne eerder as medisyne-gebaseerde bewyse. Clin. Gastroenterol. Hepatol. 12, 177–186.e3 (2014).

Noach, L., Rolf, T. & Tytgat, G. Elektronmikroskopiese studie van assosiasie tussen Helicobacter pylori en maag- en duodenale mukosa. J. Clin. Pathol. 47, 699–704 (1994).

De Francesco, V. et al. Rol van MIC vlakke van weerstand teen klaritromisien en metronidasool in Helicobacter pylori uitwissing. J. Antimikrob. Chemother. 74, 772–774 (2019).

Graham, D. Y. et al. Faktore wat die uitwissing van Helicobacter pylori met drievoudige terapie. Gastroënterologie 102, 493–496 (1992).

Buring, S. M., Winner, L. H., Hatton, R. C. & Doering, P. L. Stakingskoerse van Helicobacter pylori behandelingsregimes: 'n meta-analise. Farmakoterapie 19, 324–332 (1999).

Tang, H.-L., Li, Y., Hu, Y.-F., Xie, H.-G. & Zhai, S.-D. Effekte van CYP2C19 verlies-van-funksie variante op die uitwissing van H. pylori infeksie in pasiënte behandel met protonpomp-inhibeerder-gebaseerde drievoudige terapie regimes: 'n meta-analise van gerandomiseerde kliniese proewe. PLoS EEN 8, e62162 (2013).

Horikawa, C. et al. Hoë risiko van mislukte uitwissing van Helicobacter pylori by pasiënte met diabetes: 'n meta-analise. Diabetes Res. Clin. Oefen. 106, 81–87 (2014).

Kaneko, F. et al. Hoë voorkomssyfer van Helicobacter pylori weerstand teen klaritromisien tydens langtermyn veelvuldige antibiotika-terapie vir chroniese respiratoriese siektes wat deur nie-tuberkulêre mikobakterieë veroorsaak word. Voeding. Pharmacol. Daar. 20 (Suppl. 1), 62–67 (2004).

Adamsson, I., Edlund, C. & Nord, C. Impak van behandeling van Helicobacter pylori op die normale gastro-intestinale mikroflora. Clin. Mikrobiol. Infekteer. 6, 175–177 (2000).

Jakobsson, H. et al. Makrolied weerstand in die normale mikrobiota na Helicobacter pylori behandeling. Scand. J. Infekteer. Dis. 39, 757–763 (2007).

Chen, L. et al. Die impak van Helicobacter pylori infeksie, uitwissingsterapie en probiotiese aanvulling op derm mikro-omgewing homeostase: 'n oop-etiket, gerandomiseerde kliniese proef. EBioMedisine 35, 87–96 (2018).

Yang, L. et al. Helicobacter pylori infeksie vererger dysbiose van dermmikrobiome by kinders met gastritis. Voorkant. Sel. Infekteer. Mikrobiol. 9, 375 (2019).

Wu, L. et al. Effekte van anti-H. pylori drievoudige terapie en 'n probiotiese kompleks op intestinale mikrobiota in duodenale ulkus. Wetenskap. Rep. 9, 12874 (2019).

Iino, C. et al. Infeksie van Helicobacter pylori en atrofiese gastritis invloed Lactobacillus in dermmikrobiota in 'n Japannese bevolking. Voorkant. Immunol. 9, 712 (2018).

Guo, Y. et al. Effek van Helicobacter pylori oor gastroïntestinale mikrobiota: 'n bevolkingsgebaseerde studie in Linqu, 'n hoërisikogebied van maagkanker. Darm 69, 1598–1607 (2020).

Megraud, F. Weerstand van Helicobacter pylori aan antibiotika. Voeding. Pharmacol. Daar. 11, 43–53 (1997).

Hombach, M., Zbinden, R. & Böttger, E. C. Standaardisering van skyfdiffusieresultate vir antibiotika vatbaarheidstoetsing deur die sirscan outomatiese soneleeser te gebruik. BMC Microbiol. 13, 225 (2013).

Smith, S., Fowora, M. & amp Pellicano, R. Infeksies met Helicobacter pylori en uitdagings wat in Afrika teëgekom word. Wêreld J. Gastroenterol. 25, 3183 (2019).

Şen, N., Yilmaz, Ö., Şımşek, İ., Küpelıoğlu, A. A. & Ellıdokuz, H. Opsporing van Helicobacter pylori DNA deur 'n eenvoudige stoel PCR metode in volwasse dyspeptiese pasiënte. Helicobacter 10, 353–359 (2005).

Clayton, C., Kleanthous, H., Coates, P., Morgan, D. & Tabaqchali, S. Sensitiewe opsporing van Helicobacter pylori deur gebruik te maak van polimerase kettingreaksie. J. Clin. Mikrobiol. 30, 192–200 (1992).

van Doorn, L.-J. et al. Akkurate voorspelling van makroliedweerstand in Helicobacter pylori deur 'n PCR-lyn-probe-toets vir die opsporing van mutasies in die 23S rRNA geen: multisentrum validering studie. Antimikrobiese. Agente Chemother. 45, 1500–1504 (2001).

Schabereiter-Gurtner, C. et al. Nuwe intydse PCR-toets vir opsporing van Helicobacter pylori infeksie en gelyktydige klaritromisien-gevoeligheidstoetsing van stoelgang- en biopsiemonsters. J. Clin. Mikrobiol. 42, 4512–4518 (2004).

Mitui, M., Patel, A., Leos, N. K., Doern, C. D. & Park, J. Y. Novel Helicobacter pylori volgordebepalingstoets identifiseer hoë koers van klaritromisienweerstand. J. Pediatriese Gastroenterol. Nutr. 59, 6–9 (2014).

Rüssmann, H. et al. Vinnige en akkurate bepaling van genotipiese klaritromisienweerstand in gekweekte Helicobacter pylori deur fluoresserende in situ hibridisasie. J. Clin. Mikrobiol. 39, 4142–4144 (2001).

Nishizawa, T. & Suzuki, H. Meganismes van Helicobacter pylori antibiotiese weerstand en molekulêre toetsing. Voorkant. Mol. Biosci. 1, 19 (2014).

Nishizawa, T. et al. Vinnige opsporing van puntmutasies wat weerstand teen fluorokinolon verleen in gyrA van Helicobacter pylori deur alleel-spesifieke PKR. J. Clin. Mikrobiol. 45, 303–305 (2007).

Patel, S. K., Pratap, C. B., Jain, A. K., Gulati, A. K. & Nath, G. Diagnosis of Helicobacter pylori: wat moet die goudstandaard wees? Wêreld J. Gastroenterol. 20, 12847–12859 (2014).

Ciesielska, U., Jagoda, E. & Marciniak, Z. Waarde van PCR-tegniek in opsporing van Helicobacter pylori in paraffien-ingebedde materiaal. Folia Histochem. Sitobiol. 40, 129–130 (2002).

Maljkovic, I. B. et al. Volgende generasie volgordebepaling en bioinformatika-metodologieë vir navorsing oor aansteeklike siektes en openbare gesondheid: benaderings, toepassings en oorwegings vir die ontwikkeling van laboratoriumkapasiteit. J. Infekteer. Dis. 221 (Bylaag 3), 292–307 (2020).

Hendriksen, R. S. et al. Die gebruik van genomika om globale antimikrobiese weerstand op te spoor. Voorkant. Openbare gesondheid 7, 242 (2019).

Su, M., Satola, S. W. & Read, T. D. Genoom-gebaseerde voorspelling van bakteriële antibiotika weerstand. J. Clin. Mikrobiol. 57, e01405-18 (2019).

Gardy, J. L. & Loman, N. J. Op pad na 'n genomika-ingeligte, intydse, globale patogeen-toesigstelsel. Nat. Ds Genet. 19, 9–20 (2018).

Goldberg, B., Sichtig, H., Geyer, C., Ledeboer, N. & Weinstock, G. M. Maak die sprong van navorsingslaboratorium na kliniek: uitdagings en geleenthede vir volgende-generasie volgordebepaling in aansteeklike siekte diagnostiek. mBio 6, e01888-15e01888-15 (2015).

MacCannell, D. Volgende generasie volgordebepaling in kliniese en openbare gesondheidsmikrobiologie. Clin. Mikrobiol. Nuusl. 38, 169–176 (2016).

Moss, E. L., Maghini, D. G. & Bhatt, A. S. Volledige, geslote bakteriese genome van mikrobiome met behulp van nanopore-volgordebepaling. Nat. Biotegnologie. 38, 701–707 (2020).

D'Elios, M. M. & Czinn, S. J. Immuniteit, inflammasie en entstowwe vir Helicobacter pylori. Helicobacter 19, 19–26 (2014).

Zeng, M. et al. Doeltreffendheid, veiligheid en immunogenisiteit van 'n orale rekombinant Helicobacter pylori entstof by kinders in China: 'n gerandomiseerde, dubbelblinde, placebo-beheerde, fase 3-proef. Lancet 386, 1457–1464 (2015).

Graham, D. Y. & Dore, M. P. Helicobacter pylori terapie: 'n paradigmaskuif. Deskundige Ds Anti Infect. Daar. 14, 577–585 (2016).

Hori, Y. et al. 1-[5-(2-Fluorfeniel)-1-(piridien-3-ylsulfoniel)-1H-pirrol-3-yl]-N-metielmetanamienmonofumaraat (TAK-438), 'n nuwe en kragtige kalium-mededingende suurblokker vir die behandeling van suurverwante siektes. J. Pharmacol. Exp. Daar. 335, 231–238 (2010).

Murakami, K. et al. Vonoprazan, 'n nuwe kalium-mededingende suurblokker, as 'n komponent van eerste-lyn en tweede-lyn drievoudige terapie vir Helicobacter pylori uitwissing: 'n fase III, gerandomiseerde, dubbelblinde studie. Darm 65, 1439–1446 (2016).

Kiyotoki, S., Nishikawa, J. & Sakaida, I. Doeltreffendheid van vonoprazan vir Helicobacter pylori uitwissing. Int. Med. 59, 153–161 (2020).

McFarland, L. V., Huang, Y., Wang, L. & Malfertheiner, P. Sistematiese oorsig en meta-analise: multi-stam probiotika as bykomende terapie vir Helicobacter pylori uitwissing en voorkoming van nadelige gebeurtenisse. Verenigde Europese Gastroenterol. J. 4, 546–561 (2016).

Zhang, M.-M., Qian, W., Qin, Y.-Y., He, J. & Zhou, Y.-H. Probiotika in Helicobacter pylori uitwissingsterapie: 'n sistematiese oorsig en meta-analise. Wêreld J. Gastroenterol. 21, 4345–4357 (2015).

Shi, X. et al. Doeltreffendheid en veiligheid van probiotika in die uitwissing Helicobacter pylori: 'n netwerk meta-analise. Medisyne 98, e15180 (2019).

Mégraud, F., Occhialini, A. & Rossignol, J. F. Nitazoxanide, 'n potensiële middel vir die uitwissing van Helicobacter pylori met geen kruisweerstand teen metronidasool nie. Antimikrobiese. Agente Chemother. 42, 2836–2840 (1998).

Yamamoto, Y. et al. Nitazoxanide, 'n nitrotiazolied antiparasitiese middel, is 'n anti-Helicobacter pylori middel met anti-vakuolerende toksienaktiwiteit. Chemoterapie 45, 303–312 (1999).

Mohammadi, M., Attaran, B., Malekzadeh, R. & Graham, D. Y. Furazolidone, 'n onderbenutte middel vir H. pylori uitwissing: lesse uit Iran. Grawe. Dis. Wetenskap. 62, 1890–1896 (2017).

Matsuzaki, J. et al. Doeltreffendheid van sitafloxacin-gebaseerde reddingsterapie vir Helicobacter pylori na mislukkings van eerste- en tweedelyn-terapieë. Antimikrobiese. Agente Chemother. 56, 1643–1645 (2012).

Sugimoto, M. et al. Hoog Helicobacter pylori genesingstempo met sitafloxacin-gebaseerde drievoudige terapie. Voeding. Pharmacol. Terapeuut. 42, 477–483 (2015).

Nilius, A. M. et al. In vitro antibakteriese krag en spektrum van ABT-492, 'n nuwe fluorokinolon. Antimikrobiese. Agente Chemother. 47, 3260–3269 (2003).

Van Bambeke, F. Delafloxacin, 'n nie-zwitterioniese fluorokinolon in fase III van kliniese ontwikkeling: evaluering van sy farmakologie, farmakokinetika, farmakodinamika en kliniese doeltreffendheid. Toekomstige mikrobiool. 10, 1111–1123 (2015).

Mori, H., Suzuki, H., Matsuzaki, J., Masaoka, T. & Kanai, T. Antibiotiese weerstand en gyrA mutasie beïnvloed die doeltreffendheid van 10-dae sitafloxacin-metronidasool-esomeprazol-terapie vir Helicobacter pylori in penisillien-allergiese pasiënte. Verenigde Europese Gastroenterol. J. 5, 796–804 (2017).

Suzuki, H., Nishizawa, T., Muraoka, H. & Hibi, T. Sitafloxacin en garenoxacin kan die antibiotika-weerstandigheid van Helicobacter pylori met gyrA mutasie. Antimikrobiese. Agente Chemother. 53, 1720–1721 (2009).

Shah, S.C., Iyer, P.G. & Moss, S.F. AGA kliniese praktykopdatering oor die bestuur van vuurvaste Helicobacter pylori infeksie: deskundige oorsig. Gastroënterologie 160, 1831–1841 (2021).

Hong, J. et al. Antibiotiese weerstand en CYP2C19 polimorfismes beïnvloed die doeltreffendheid van gepaardgaande terapieë vir Helicobacter pylori infeksie: 'n oop-etiket, gerandomiseerde, enkelsentrum kliniese proef. J. Antimikrob. Chemother. 71, 2280–2285 (2016).

Berthenet, E. et al. 'n GWAS aan Helicobacter pylori stamme dui op genetiese variante wat verband hou met maagkanker risiko. BMC Biol. 16, 84 (2018).

Windham, I. H. et al. Helicobacter pylori biofilmvorming word differensieel deur algemene kultuurtoestande beïnvloed, en proteïene speel 'n sentrale rol in die biofilmmatriks. Appl. Omgewing. Mikrobiol. 84, e00391-18 (2018).

Chen, X. et al. Rhamnolipied-betrokke antibiotika kombinasies verbeter die uitwissing van Helicobacter pylori biofilm in vitro: 'n vergelyking met konvensionele drievoudige terapie. Mikrob. Pathog. 131, 112–119 (2019).

Tsugawa, H. et al. Alfa-ketoglutaraatoksidoreduktase, 'n noodsaaklike reddingsensiem van energiemetabolisme, in kokoïedvorm van Helicobacter pylori. Biochem. Biofis. Res. Commun. 376, 46–51 (2008).

Hindson, B.J. et al. Hoë-deurset druppel digitale PCR-stelsel vir absolute kwantifisering van DNA-kopienommer. Anaal. Chem. 83, 8604–8610 (2011).

Talarico, S. et al. Hoë voorkoms van Helicobacter pylori klaritromisienweerstandsmutasies onder Seattle-pasiënte gemeet deur druppel digitale PCR. Helicobacter 23, e12472 (2018).

Sedlak, R. H., Kuypers, J. & Jerome, K. R. 'n Multiplekse druppel digitale PCR-toets presteer beter as qPCR op monsters wat geneig is tot inhibisie. Diagn. Mikrobiol. Infekteer. Dis. 80, 285–286 (2014).

Lee, K.H. et al. Kan aminoglikosiede gebruik word as 'n nuwe behandeling vir Helicobacter pylori? In vitro aktiwiteit van onlangs geïsoleer Helicobacter pylori. Infekteer. Chemother. 51, 10–20 (2019).

Jeong, S.J. et al. Gentamisien-geïnterkaleerde smektiet as 'n nuwe terapeutiese opsie vir Helicobacter pylori uitwissing. J. Antimikrob. Chemother. 73, 1324–1329 (2018).

Shi, J., Jiang, Y. & Zhao, Y. Belowende in vitro en in vivo inhibisie van multi-middel-weerstandige Helicobacter pylori deur linezolid en nuwe oxazolidinone analoë. J. Glob. Antimikrobiese. Weerstaan. 7, 106–109 (2016).

Kiga, K. et al. Ontwikkeling van CRISPR-Cas13a-gebaseerde antimikrobiese middels wat in staat is om volgorde-spesifieke doodmaak van teikenbakterieë. Nat. Commun. 11, 2934 (2020).

Latham, S. R., Labigne, A. & Jenks, P. J. Produksie van die RdxA-proteïen in metronidasool-vatbare en -weerstandige isolate van Helicobacter pylori gekweek van behandelde muise. J. Antimikrob. Chemother. 49, 675–678 (2002).

Kim, S.Y. et al. Genetiese ontleding van Helicobacter pylori kliniese isolate dui daarop dat weerstand teen metronidasool kan voorkom sonder die verlies van funksionele RdxA. J. Antibiotikum. 62, 43–50 (2009).

Binh, T. T., Suzuki, R., Trang, T. T. H., Kwon, D. H. & Yamaoka, Y. Soek na nuwe kandidaatmutasies vir metronidasoolweerstand in Helicobacter pylori gebruik volgende-generasie volgordebepaling. Antimikrobiese. Agente Chemother. 59, 2343–2348 (2015).

Suzuki, S. et al. Vorige rifampisiendosering bepaal rifabutienweerstand van Helicobacter pylori. Spysvertering 79, 1–4 (2009).

Den Dunnen, J. & Antonarakis, S. Nomenklatuur vir die beskrywing van menslike volgordevariasies. Hom. Genet. 109, 121–124 (2001).

Ogino, S. et al. Standaard mutasie nomenklatuur in molekulêre diagnostiek: praktiese en opvoedkundige uitdagings. J. Mol. Diag. 9, 1–6 (2007).

Kliniese en Laboratorium Standaarde Instituut. Prestasiestandaarde vir antimikrobiese vatbaarheidstoetsing. (Instituut vir Kliniese en Laboratoriumstandaarde, 2016).

Kahlmeter, G. et al. Europese Komitee vir Antimikrobiese Vatbaarheidstoetsing (EUCAST) tegniese notas oor antimikrobiese vatbaarheidstoetsing. Clin. Mikrobiol. Infekteer. 12, 501–503 (2006).

Gao, C. et al. Uitroeiing behandeling van Helicobacter pylori infeksie gebaseer op molekulêre patologiese antibiotika weerstand. Infekteer. Dwelm. Weerstaan. 13, 69–79 (2020).

Luo, X.-F. et al. Vestiging van 'n geneste-ASP-PCR-metode om die klaritromisienweerstand van Helicobacter pylori. Wêreld J. Gastroenterol. 22, 5822–5830 (2016).

Ménard, A., Santos, A., Mégraud, F. & Oleastro, M. PCR-beperking fragment lengte polimorfisme kan ook puntmutasie A2142C in die 23S rRNA geen, geassosieer met Helicobacter pylori weerstand teen klaritromisien. Antimikrobiese. Agente Chemother. 46, 1156–1157 (2002).

Occhialini, A. et al. Makrolied weerstand in Helicobacter pylori: vinnige opsporing van puntmutasies en toetse van makroliedbinding aan ribosome. Antimikrobiese. Agente Chemother. 41, 2724–2728 (1997).

Szczebara, F., Dhaenens, L., Vincent, P. & Husson, M. Evaluering van vinnige molekulêre metodes vir die opsporing van klaritromisienweerstand in Helicobacter pylori. EUR. J. Clin. Mikrobiol. Infekteer. Dis. 16, 162–164 (1997).

Versalovic, J. et al. Puntmutasies in die 23S rRNA geen van Helicobacter pylori geassosieer met verskillende vlakke van klaritromisienweerstand. J. Antimikrob. Chemother. 40, 283–286 (1997).

Ribeiro, M. L. et al. Opsporing van hoëvlak tetrasiklienweerstand in kliniese isolate van Helicobacter pylori gebruik van PCR-RFLP. FEMS Immunol. Med. Mikrobiol. 40, 57–61 (2004).

Stone, G. G. et al. 'n PCR-oligonukleotied afbindingstoets om die voorkoms van 23S rRNA geenmutasies in klaritromisien-weerstandige te bepaal Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 41, 712–714 (1997).

Nahm, J. H., Kim, W. K., Kwon, Y. & Kim, H. Opsporing van Helicobacter pylori met klaritromisienweerstand-geassosieerde mutasies deur gebruik te maak van peptied-nukleïensuur-probe-gebaseerde smeltpuntanalise. Helicobacter 24, e12634 (2019).

Lehours, P., Siffré, E. & Mégraud, F. DPO multipleks PCR as 'n alternatief vir kultuur en vatbaarheidstoetsing om op te spoor Helicobacter pylori en sy weerstand teen klaritromisien. BMC Gastroenterol. 11, 112 (2011).

Pina, M., Occhialini, A., Monteiro, L., Doermann, H.-P. & Mégraud, F. Opsporing van puntmutasies wat verband hou met weerstand van Helicobacter pylori na klaritromisien deur hibridisasie in vloeibare fase. J. Clin. Mikrobiol. 36, 3285–3290 (1998).

Van Doorn, L. J. et al. Vinnige opsporing, deur PCR en omgekeerde hibridisasie, van mutasies in die Helicobacter pylori 23S rRNA geen, geassosieer met makrolied weerstand. Antimikrobiese. Agente Chemother. 43, 1779–1782 (1999).

Maeda, S. et al. Opsporing van klaritromisien-weerstandige Helicobacter pylori stamme deur 'n voorkeur homodupleks vormingstoets. J. Clin. Mikrobiol. 38, 210–214 (2000).

Alarcón, T., Domingo, D., Prieto, N. & Lopez-Brea, M. Clarithromycin weerstandstabiliteit in Helicobacter pylori: invloed van die MIC en tipe mutasie in die 23S rRNA. J. Antimikrob. Chemother. 46, 613–616 (2000).

Chisholm, S. A., Owen, R. J., Teare, E. L. & Saverymuttu, S. PCR-gebaseerde diagnose van Helicobacter pylori infeksie en intydse bepaling van klaritromisienweerstand direk vanaf menslike maagbiopsiemonsters. J. Clin. Mikrobiol. 39, 1217–1220 (2001).

Gibson, J., Saunders, N., Burke, B. & Owen, R. Nuwe metode vir vinnige bepaling van klaritromisien sensitiwiteit in Helicobacter pylori. J. Clin. Mikrobiol. 37, 3746–3748 (1999).

Matsumura, M. et al. Vinnige opsporing van mutasies in die 23S rRNA geen van Helicobacter pylori wat weerstand teen klaritromisienbehandeling aan die bakterie verleen. J. Clin. Mikrobiol. 39, 691–695 (2001).

Oleastro, M. et al. Intydse PCR-toets vir vinnige en akkurate opsporing van puntmutasies wat weerstand teen klaritromisien in Helicobacter pylori. J. Clin. Mikrobiol. 41, 397–402 (2003).

Glocker, E., Berning, M., Gerrits, M., Kusters, J. & Kist, M. Real-time PCR-sifting vir 16S rRNA mutasies wat verband hou met weerstand teen tetrasiklien in Helicobacter pylori. Antimikrobiese. Agente Chemother. 49, 3166–3170 (2005).

Glocker, E. & Kist, M. Vinnige opsporing van puntmutasies in die gyrA geen van Helicobacter pylori weerstand teen siprofloksasien verleen deur 'n fluoressensie-resonansie-energie-oordrag-gebaseerde intydse PCR-benadering. J. Clin. Mikrobiol. 42, 2241–2246 (2004).

Da Hyun Jung, J.-H. K. et al. Peptied-nukleïensuur-sonde-gebaseerde analise as 'n nuwe opsporingsmetode vir klaritromisienweerstand in Helicobacter pylori. Ingewande lewer 12, 641–647 (2018).

Yilmaz, Ö. & Demiray, E. Kliniese rol en belangrikheid van fluoressensie in situ hibridisasie metode in diagnose van H pylori infeksie en bepaling van klaritromisienweerstand in H pylori uitwissingsterapie. Wêreld J. Gastroenterol. 13, 671–675 (2007).

Trebesius, K. et al. Vinnige en spesifieke opsporing van Helicobacter pylori makroliedweerstand in maagweefsel deur fluoresserende in situ hibridisasie. Darm 46, 608–614 (2000).

Cerqueira, L. et al. PNA-FISH as 'n nuwe diagnostiese metode vir die bepaling van klaritromisienweerstand van Helicobacter pylori. BMC Microbiol. 11, 101 (2011).

Latham, S. R., Owen, R. J., Elviss, N. C., Labigne, A. & Jenks, P. J. Differensiasie van metronidasool-sensitiewe en -weerstandige kliniese isolate van Helicobacter pylori deur immunoblotting met antisera teen die RdxA-proteïen. J. Clin. Mikrobiol. 39, 3052–3055 (2001).

Fauzia, K. A. et al. Biofilm vorming en antibiotika weerstand fenotipe van Helicobacter pylori kliniese isolate. Gifstowwe 12, 473 (2020).

Slatko, B. E., Gardner, A. F. & Ausubel, F. M. Oorsig van volgende-generasie volgordebepaling tegnologie. Curr. Protoc. Mol. Biol. 122, e59 (2018).



Kommentaar:

  1. Collis

    Wat 'n geluk!

  2. Mika'il

    Natuurlik, ek is jammer, maar kan u asseblief 'n bietjie meer inligting gee.

  3. Rodger

    Parafraseer asseblief die boodskap

  4. Shakus

    Onvergelykbare onderwerp



Skryf 'n boodskap