Inligting

7.1A: Bakteriële genome - Biologie

7.1A: Bakteriële genome - Biologie



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Leerdoelwitte

  • Verduidelik die basiese kenmerke van bakteriese genome

Bakteriële genome is oor die algemeen kleiner en minder variasie in grootte tussen spesies in vergelyking met genome van diere en enkelsel-eukariote. Bakteriële genome kan in grootte wissel van 139 kbp tot 13 000 kbp. Onlangse vooruitgang in volgordebepalingtegnologie het gelei tot die ontdekking van 'n hoë korrelasie tussen die aantal gene en die genoomgrootte van bakterieë, wat daarop dui dat bakterieë relatief klein hoeveelhede rommel-DNS het.

Studies het sedertdien getoon dat 'n groot aantal bakteriese spesies genomiese agteruitgang ondergaan het wat gelei het tot 'n afname in genoomgrootte vanaf hul voorvaderlike toestand. Oor die jare het navorsers verskeie teorieë voorgestel om die algemene neiging van bakteriële genoomverval en die relatief klein grootte van bakteriese genome te verduidelik. Dwingende bewyse dui daarop dat die oënskynlike agteruitgang van bakteriese genome te danke is aan 'n uitwissende vooroordeel.

By prokariote is die meeste van die genoom (85-90%) nie-herhalende DNA, wat beteken dat kodende DNA dit hoofsaaklik vorm, terwyl nie-koderende streke slegs 'n klein deel neem. Die meeste biologiese entiteite wat meer kompleks as 'n virus is, dra soms of altyd bykomende genetiese materiaal behalwe dit wat in hul chromosome woon. In sommige kontekste, soos die volgordebepaling van die genoom van 'n patogene mikrobe, is "genoom" bedoel om inligting in te sluit wat op hierdie hulpmateriaal gestoor word, wat in plasmiede gedra word. In sulke omstandighede beskryf "genoom" dan al die gene en inligting oor nie-koderende DNA wat die potensiaal het om teenwoordig te wees.

Tussen spesies bakterieë is daar relatief min variasie in genoomgrootte in vergelyking met die genoomgroottes van ander groot groepe lewe. Genoomgrootte is van min relevansie wanneer die aantal funksionele gene in eukariotiese spesies in ag geneem word. In bakterieë maak die sterk korrelasie tussen die aantal gene en die genoomgrootte egter die grootte van bakteriese genome 'n interessante onderwerp vir navorsing en bespreking. Die algemene tendense van bakteriële evolusie dui daarop dat bakterieë as vrylewende organismes begin het. Evolusionêre paaie het daartoe gelei dat sommige bakterieë patogene en simbiote geword het.

Figuur 7.1A: Grafiek van variasie in beraamde genoomgroottes in basispare.: Anders as eukariote, toon bakterieë 'n sterk korrelasie tussen genoomgrootte en aantal funksionele gene in 'n genoom. Genoomgrootte wissel (in basispare) van verskeie lewensvorme. (CC BY-SA 4.0; Abizar).

Die lewenstyl van bakterieë speel 'n integrale rol in hul onderskeie genoomgroottes. Vrylewende bakterieë het die grootste genome uit die drie tipes bakterieë; hulle het egter minder pseudogene as bakterieë wat onlangs patogenisiteit verkry het. Fakultatiewe en onlangs geëvolueerde patogene bakterieë vertoon 'n kleiner genoomgrootte as vrylewende bakterieë, maar hulle het meer pseudogene as enige ander vorm van bakterieë. Verpligte bakteriële simbione of patogene het die kleinste genome en die minste aantal pseudogene van die drie groepe. Die verhouding tussen lewenstyl van bakterieë en genoomgrootte laat vrae ontstaan ​​oor die meganismes van bakteriële genoom-evolusie.

Navorsers het verskeie teorieë ontwikkel om die patrone van genoomgrootte-evolusie onder bakterieë te verduidelik. Een teorie voorspel dat bakterieë kleiner genome het as gevolg van 'n selektiewe druk op genoomgrootte om vinniger replikasie te verseker. Die teorie is gebaseer op die logiese uitgangspunt dat kleiner bakteriese genome minder tyd sal neem om te repliseer. Vervolgens sal kleiner genome verkieslik geselekteer word as gevolg van verbeterde fiksheid.

Delesionele vooroordeel seleksie is maar een proses betrokke by evolusie. Twee ander groot prosesse (mutasie en genetiese drywing) kan gebruik word om die genoomgroottes van verskeie tipes bakterieë te verduidelik.

Bewyse van 'n delesie-vooroordeel is teenwoordig in die onderskeie genoomgroottes van vrylewende bakterieë, fakultatiewe en onlangs afgeleide parasiete en verpligte parasiete en simbiote. Vrylewende bakterieë is geneig om groot bevolkingsgroottes te hê en is onderhewig aan meer geleentheid vir geenoordrag. As sodanig kan seleksie effektief op vrylewende bakterieë werk om skadelike volgordes te verwyder wat lei tot 'n relatief klein aantal pseudogene. Voortdurend is verdere selektiewe druk sigbaar aangesien vrylewende bakterieë alle geenprodukte onafhanklik van 'n gasheer moet produseer. Gegewe dat daar voldoende geleentheid is vir geenoordrag om plaas te vind en daar selektiewe druk is teen selfs effens skadelike delesies, is dit intuïtief dat vrylewende bakterieë die grootste bakteriese genome van alle bakterieëtipes moet hê. Onlangs gevormde parasiete ondergaan ernstige knelpunte en kan staatmaak op gasheeromgewings om geenprodukte te verskaf. As sodanig is daar in onlangs gevormde en fakultatiewe parasiete 'n ophoping van pseudogene en transponeerbare elemente as gevolg van 'n gebrek aan selektiewe druk teen delesies. Die populasie-knelnekke verminder geenoordrag en as sodanig verseker delesie-vooroordeel die vermindering van genoomgrootte in parasitiese bakterieë.

Kern punte

  • By prokariote is die meeste van die genoom (85-90%) nie-herhalende, kodende DNA, terwyl die oorblywende DNA nie-koderend is.
  • Die genoom van 'n patogene mikrobe, "genoom", is bedoel om inligting in te sluit wat op hierdie hulpmateriaal gestoor word, wat in plasmiede gedra word.
  • Die lewenstyl van bakterieë speel 'n integrale rol in hul onderskeie genoomgroottes. Vrylewende bakterieë het die grootste genome uit die drie tipes bakterieë; hulle het egter minder pseudogene as bakterieë wat onlangs patogenisiteit verkry het.

Sleutel terme

  • genoom: Die volledige genetiese inligting (óf DNA of, in sommige virusse, RNA) van 'n organisme, tipies uitgedruk in die aantal basispare.

Bakteriese genome

Pierre-Edouard Fournier, Didier Raoult, in aansteeklike siektes (vierde uitgawe), 2017

Gevolgtrekkings en perspektiewe

In 1995 het die uitkoms van bakteriële genoomvolgordebepaling deurbrake in mikrobiologie en navorsing oor aansteeklike siektes beloof. Sedertdien is byna 12 300 bakteriese genome georden. Die vermenigvuldiging van genoomvolgordebepalingsprojekte, tesame met uitgebreide metagenomiese studies, sal 'n baie meer volledige beeld van die bakteriese wêreld verskaf. Die potensiaal van hierdie onskatbare bron van inligting het wetenskaplikes reeds toegelaat om die velde van bakteriële virulensie, gasheer-bakterie-interaksies, mikrobiologiese diagnose en menslike mikrobiese ekologie te heroorweeg. Ten spyte van die vele vooruitgang wat deur NGS toegelaat word, staar ons egter nuwe uitdagings in die gesig, insluitend die behoefte om verbeterde samestelling-, annotasie- en ontledingsprogramme te ontwikkel wat die groot hoeveelhede volgordedata kan hanteer wat deur nuwe volgordebepalingtegnologieë geproduseer word, die voortdurend groeiende aantal genomiese volgordes. , en die kompleksiteit van rye in metagenomiese studies. Of enkelselgenomika sal help om sommige van hierdie kwessies op te los, bly onseker. Ten slotte, daar is nie huidige minimum kriteria vir genoomvolgorde kwaliteit nie, die meerderheid is onvoltooide, of 'konsep' of 'vuil' genome, 30 en sulke standaarde kan nuttig wees om betroubare genoomvergelykings te verkry.

Verwysings aanlyn beskikbaar by expertconsult.com .


Genoomterminologie

Kb/Mb - 'n Kilobasis (Kb) is 1 000 basisse DNA, terwyl 'n megabasis (Mb) 1 000 000 basisse is.
Sirkelvormige chromosoom ·Die DNS is in 'n geslote sirkel gerangskik, wat negatief supergewikkel is, wat die kompakte aard van baie bakteriese genome moontlik maak.
Lineêre Chromosoom · 'n Nie-geslote chromosoom, wat omgekeerde herhalings aan die punte het, soortgelyk aan teleomere in eukariotiese chromosome.
Plasmied · Ekstra-chromosomale DNA wat onafhanklik van die chromosoom repliseer en sy eie replikasie reguleer.
Megaplasmied · 'n Baie groot plasmied wat in grootte wissel van 100- 1700 Kb.


Laterale geenoordrag en die oorsprong van evolusionêre nuwigheid

In dierspesies ontstaan ​​evolusionêre nuwighede as mutante allele binne populasies. As gevolg van die teenwoordigheid van geslag en rekombinasie, kan seleksie hul fiksasie bewerkstellig onafhanklik van allele by ander lokusse. Bakterieë is tradisioneel beskou as ongeslagtelike mense wat nie rekombinasie het nie, met hul bevolkings as klone [2, 15, 16]. Begunstigde allele kan nog steeds tot fiksasie vee, maar hulle bring die res van die genoom waarin hulle die eerste keer voorgekom het saam vir die rit. Tog sou selfs radikale (spesie-stigtende) evolusionêre nuwighede ontstaan ​​as mutasies wat binne die voorvaderlike bakteriese populasie voorkom. En, vir beide dier- en bakteriese spesies, genomiese samehang - wat ons kan definieer as 'n groter mate van ooreenkoms in geeninhoud (die werklike aantal en identiteit van die gene teenwoordig) en geenvolgorde (die volgorde van ooreenstemmende gene) binne spesies as tussen spesies - sal in stand gehou word deur die selektiewe suiwering van veranderlikheid, een geen op 'n slag in seksuele spesies en een genoom op 'n slag in ongeslagtelike. (In die vroeë dae van bakteriële genetika is hierdie genomiese veeproses 'periodieke seleksie' genoem).

Maar genomika vertel ons dat bakterieë dikwels evolusionêre nuwighede van buite die voorvaderlike bevolking verkry deur LGT [16-18]. Die beste bestudeer, nie verbasend nie, is bakterieë wat patogene geword het deur die verkryging van nuwe plasmiede, chromosomale gene of mobiele patogenisiteit-eilande [19], maar nie-patogene ontwikkel ook op hierdie soutagtige wyse. Van 'n onlangse vergelykende genomika/metagenomika-studie van die sianobakterie Prochlorococcus, die see se vernaamste prokariotiese fotosinteerder, Coleman et al. [20] kom tot die gevolgtrekking dat "genetiese variasie tussen fenotipies verskillende stamme wat met minder as 1% verskil in 16S ribosomale RNA-volgordes, meestal in genomiese eilande voorkom. Eilandgene blyk deels verkry te wees deur faag-gemedieerde laterale geenoordrag, en sommige is differensieel uitgedruk onder lig- en voedingstofstres."

In hierdie en baie soortgelyke gevalle kan baie gene wat 'n hoogs komplekse aanpassing verleen, in een gebeurtenis verkry word, wat 'n enkele populasie onmiddellik in twee subpopulasies verdeel wat aansienlik verskil in lewenstyl, maar steeds in 'n gemeenskaplike genepoel deel. LGT ontkoppel die evolusie van fenotipe radikaal van die evolusie van die grootste deel van die genoom, aangesien dit weerspieël word in algehele genoomooreenkoms (koherensie). Byvoorbeeld, Bacillus anthracis (stam Ames voorouer), Bacillus cereus (ATCC1098) en Bacillus thuringiensis (serovar konkukian str. 97-27) toon almal meer as 94% ANI (en so is 'n enkele spesie volgens hierdie kriterium en ander), en is hoogs sintenies in chromosoomstruktuur. En tog is hulle beroemd anders in fenotipe - onderskeidelik 'n virulente patogeen en potensieel dodelike bioterreurmiddel, 'n oorsaak van voedselvergiftiging en 'n gewilde eko-vriendelike organiese bioplaagdoder.


7.1A: Bakteriële genome - Biologie

Acaryochloris marina MBIC11017, volledige genoom.
NC_009925
6 503 724 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB1, volledige volgorde.
NC_009926
374 161 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB2, volledige volgorde.
NC_009927
356 087 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB3, volledige volgorde.
NC_009928
273 121 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB4, volledige volgorde.
NC_009929
226 680 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB5, volledige volgorde.
NC_009930
177 162 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB6, volledige volgorde.
NC_009931
172 728 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB7, volledige volgorde.
NC_009932
155 110 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB8, volledige volgorde.
NC_009933
120 693 bp

Acaryochloris marina MBIC11017 plasmied pREB9, volledige volgorde.
NC_009934
2 133 bp

Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01, volledige genoom.
NC_013209
2 907 495 bp

Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmied pAPA01-011, volledige volgorde.
NC_013210
191 799 bp

Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmied pAPA01-020, volledige volgorde.
NC_013211
182 940 bp

Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmied pAPA01-030, volledige volgorde.
NC_013212
49 961 bp

Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmied pAPA01-040, volledige volgorde.
NC_013213
3 204 bp

Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmied pAPA01-050, volledige volgorde.
NC_013214
3 035 bp

Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01 plasmied pAPA01-060, volledige volgorde.
NC_013215
1 815 bp

Acholeplasma laidlawii PG-8A, volledige genoom.
NC_010163
1 496 992 bp

Acidaminococcus fermentans DSM 20731, volledige genoom.
NC_013740
2 329 769 bp

Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331, volledige genoom.
NC_013124
2 158 157 bp

Acidiphilium cryptum JF-5, volledige genoom.
NC_009484
3 389 227 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY01, volledige volgorde.
NC_009467
203 589 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY02, volledige volgorde.
NC_009468
187 422 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY03, volledige volgorde.
NC_009469
88 953 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY04, volledige volgorde.
NC_009470
37 415 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY05, volledige volgorde.
NC_009471
37 155 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY06, volledige volgorde.
NC_009472
8 781 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY07, volledige volgorde.
NC_009473
5 629 bp

Acidiphilium cryptum JF-5 plasmied pACRY08, volledige volgorde.
NC_009474
4 909 bp

Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270, volledige genoom.
NC_011761
2 982 397 bp

Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993, volledige genoom.
NC_011206
2 885 038 bp

Acidobacteria bakterie Ellin345, volledige genoom.
NC_008009
5 650 368 bp

Acidobacterium capsulatum ATCC 51196, volledige genoom.
NC_012483
4 127 356 bp

Acidothermus cellulolyticus 11B, volledige genoom.
NC_008578
2 443 540 bp

Acidovorax avenae subsp. citrulli AAC00-1, volledige genoom.
NC_008752
5 352 772 bp

Acidovorax ebreus TPSY, volledige genoom.
NC_011992
3 796 573 bp

Acidovorax sp. JS42, volledige genoom.
NC_008782
4 448 856 bp

Acidovorax sp. JS42 plasmied pAOVO01, volledige volgorde.
NC_008765
72 689 bp

Acidovorax sp. JS42 plasmied pAOVO02, volledige volgorde.
NC_008766
63 609 bp

Aciduliprofundum boonei T469-chromosoom, volledige genoom.
NC_013926
1 486 778 bp

Acinetobacter baumannii AB0057, volledige genoom.
NC_011586
4 050 513 bp

Acinetobacter baumannii AB0057 plasmied pAB0057, volledige volgorde.
NC_011585
8 729 bp

Acinetobacter baumannii AB307-0294, volledige genoom.
NC_011595
3 760 981 bp

Acinetobacter baumannii ACICU, volledige genoom.
NC_010611
3 904 116 bp

Acinetobacter baumannii ACICU plasmied pACICU2, volledige volgorde.
NC_010606
64 366 bp

Acinetobacter baumannii ACICU plasmied pACICU1, volledige volgorde.
NC_010605
28 279 bp

Acinetobacter baumannii ATCC 17978, volledige genoom.
NC_009085
3 976 747 bp

Acinetobacter baumannii ATCC 17978 plasmied pAB1, volledige volgorde.
NC_009083
13 408 bp

Acinetobacter baumannii ATCC 17978 plasmied pAB2, volledige volgorde.
NC_009084
11 302 bp

Acinetobacter baumannii AYE, volledige genoom.
NC_010410
3 936 291 bp

Acinetobacter baumannii AYE-plasmied p3ABAYE, volledige volgorde.
NC_010404
94 413 bp

Acinetobacter baumannii AYE plasmied p2ABAYE, volledige volgorde.
NC_010402
9 661 bp

Acinetobacter baumannii AYE plasmied p1ABAYE, volledige volgorde.
NC_010401
5 644 bp

Acinetobacter baumannii AYE plasmied p4ABAYE, volledige volgorde.
NC_010403
2 726 bp

Acinetobacter baumannii SDF, volledige genoom.
NC_010400
3 421 954 bp

Acinetobacter baumannii SDF plasmied p2ABSDF, volledige volgorde.
NC_010396
25 014 bp

Acinetobacter baumannii SDF plasmied p3ABSDF, volledige volgorde.
NC_010398
24 922 bp

Acinetobacter baumannii SDF plasmied p1ABSDF, volledige volgorde.
NC_010395
6 106 bp

Acinetobacter sp. ADP1, volledige genoom.
NC_005966
3 598 621 bp

Actinobacillus pleuropneumoniae L20, volledige genoom.
NC_009053
2 274 482 bp

Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03, volledige genoom.
NC_010278
2 242 062 bp

Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76, volledige genoom.
NC_010939
2 331 981 bp

Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmied APP7_A, volledige volgorde.
NC_010942
5 685 bp

Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmied ABB7_B, volledige volgorde.
NC_010941
4 236 bp

Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76 plasmied APP7_C, volledige volgorde.
NC_010940
3 533 bp

Actinobacillus succinogenes 130Z, volledige genoom.
NC_009655
2 319 663 bp

Actinosynnema mirum DSM 43827, volledige genoom.
NC_013093
8 248 144 bp

Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966, volledige genoom.
NC_008570
4 744 448 bp

Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449, volledige genoom.
NC_009348
4 702 402 bp

Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmied pAsa4, volledige volgorde.
NC_009349
166 749 bp

Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmied pAsa5, volledige volgorde.
NC_009350
155 098 bp

Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmied pAsa3, volledige volgorde.
NC_004924
5 616 bp

Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmied pAsa1, volledige volgorde.
NC_004923
5 424 bp

Aeromonas salmonicida salmonicida A449 plasmied pAsa2, volledige volgorde.
NC_004925
5 247 bp

Aeropyrum pernix, volledige genoom.
NC_000854
1 669 695 bp

Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1, volledige genoom.
NC_013416
2 105 764 bp

Aggregatibacter aphrophilus NJ8700, volledige genoom.
NC_012913
2 313 035 bp

Agrobacterium radiobacter K84 chromosoom 1, volledige genoom.
NC_011985
4 005 130 bp

Agrobacterium radiobacter K84 chromosoom 2, volledige genoom.
NC_011983
2 650 913 bp

Agrobacterium radiobacter K84 plasmied pAtK84c, volledige volgorde.
NC_011987
388 169 bp

Agrobacterium radiobacter K84 plasmied pAtK84b, volledige volgorde.
NC_011990
184 668 bp

Agrobacterium radiobacter K84 plasmied pAgK84, volledige volgorde.
NC_011994
44 420 bp

Agrobacterium tumefaciens-stam C58 sirkelvormige chromosoom, volledige volgorde.
NC_003062
2 841 581 bp

Agrobacterium tumefaciens-stam C58 lineêre chromosoom, volledige volgorde.
NC_003063
2 074 782 bp

Agrobacterium tumefaciens-stam C58-plasmied AT, volledige volgorde.
NC_003064
542 869 bp

Agrobacterium tumefaciens str. C58 (Cereon) plasmied Ti, volledige volgorde.
NC_003065
214 331 bp

Agrobacterium vitis S4 chromosoom 1, volledige genoom.
NC_011989
3 726 375 bp

Agrobacterium vitis S4 chromosoom 2, volledige genoom.
NC_011988
1 283 187 bp

Agrobacterium vitis S4 plasmied pAtS4e, volledige volgorde.
NC_011981
631 775 bp

Agrobacterium vitis S4 plasmied pTiS4, volledige volgorde.
NC_011982
258 824 bp

Agrobacterium vitis S4 plasmied pAtS4c, volledige volgorde.
NC_011984
211 620 bp

Agrobacterium vitis S4 plasmied pAtS4b, volledige volgorde.
NC_011991
130 435 bp

Agrobacterium vitis S4 plasmied pAtS4a, volledige volgorde.
NC_011986
78 730 bp

Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835, volledige genoom.
NC_010655
2 664 102 bp

Alcanivorax borkumensis SK2, volledige genoom.
NC_008260
3 120 143 bp

Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446, volledige genoom.
NC_013205
3 018 755 bp

Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmied pAACI01, volledige volgorde.
NC_013206
91 726 bp

Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmied pAACI02, volledige volgorde.
NC_013207
87 298 bp

Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 plasmied pAACI03, volledige volgorde.
NC_013208
7 907 bp

Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosoom 1, volledige genoom.
NC_011312
3 325 165 bp

Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosoom 2, volledige genoom.
NC_011313
1 206 461 bp

Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmied pVSAL840, volledige volgorde.
NC_011311
83 540 bp

Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmied pVSAL320, volledige volgorde.
NC_011314
30 807 bp

Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmied pVAL43, volledige volgorde.
NC_011315
5 360 bp

Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmied pVSAL43, volledige volgorde.
NC_011316
4 327 bp

Alkalilimnicola ehrlichei MLHE-1, volledige genoom.
NC_008340
3 275 944 bp

Alkaliphilus metalliredigens QYMF, volledige genoom.
NC_009633
4 929 566 bp

Alkaliphilus oremlandii OhILAS, volledige genoom.
NC_009922
3 123 558 bp

Allochromatium vinosum DSM 180 chromosoom, volledige genoom.
NC_013851
3 526 903 bp

Allochromatium vinosum DSM 180 plasmied pALVIN01, volledige volgorde.
NC_013852
102 242 bp

Allochromatium vinosum DSM 180 plasmied pALVIN02, volledige volgorde.
NC_013862
39 929 bp

Alteromonas macleodii 'Deep ecotype', volledige genoom.
NC_011138
4 412 282 bp

Aminobacterium colombiense DSM 12261 chromosoom, volledige genoom.
NC_014011
1 980 592 bp

Ammonifex degensii KC4, volledige genoom.
NC_013385
2 129 237 bp

Ammonifex degensii KC4 plasmied pADEG01, volledige volgorde.
NC_013386
27 830 bp

Anabaena variabilis ATCC 29413, volledige genoom.
NC_007413
6 365 727 bp

Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmied A, volledige volgorde.
NC_007410
366 354 bp

Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmied C, volledige volgorde.
NC_007412
300 758 bp

Anabaena variabilis ATCC 29413 plasmied B, volledige volgorde.
NC_007411
35 762 bp

Anabaena variabilis ATCC 29413, volledige genoom.
NC_014000
37 151 bp

Anaerocellum thermophilum DSM 6725, volledige genoom.
NC_012034
2 919 718 bp

Anaerocellum thermophilum DSM 6725 plasmied pATHE01, volledige volgorde.
NC_012036
8 291 bp

Anaerocellum thermophilum DSM 6725 plasmied pATHE02, volledige volgorde.
NC_012037
3 653 bp

Anaerococcus prevotii DSM 20548, volledige genoom.
NC_013171
1 883 067 bp

Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmied pAPRE01, volledige volgorde.
NC_013164
115 566 bp

Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1, volledige genoom.
NC_011891
5 029 329 bp

Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C, volledige genoom.
NC_007760
5 013 479 bp

Anaeromyxobacter sp. Fw109-5, volledige genoom.
NC_009675
5 277 990 bp

Anaeromyxobacter sp. K, volledige genoom.
NC_011145
5 061 632 bp

Anaplasma sentrale str. Israel, volledige genoom.
NC_013532
1 206 806 bp

Anaplasma marginale str. St. Maries, volledige genoom.
NC_004842
1 197 687 bp

Anaplasma marginale str. Florida, volledige genoom.
NC_012026
1 202 435 bp

Anaplasma phagocytophilum HZ, volledige genoom.
NC_007797
1 471 282 bp

Anoxybacillus flavithermus WK1, volledige genoom.
NC_011567
2 846 746 bp

Aquifex aeolicus volledige genoom.
NC_000918
1 551 335 bp

Aquifex aeolicus plasmied ece1, volledige volgorde.
NC_001880
39 456 bp

Archaeoglobus fulgidus DSM 4304, volledige genoom.
NC_000917
2 178 400 bp

Archaeoglobus profundus DSM 5631, volledige genoom.
NC_013741
1 560 622 bp

Archaeoglobus profundus DSM 5631 plasmied pArcpr01, volledige volgorde.
NC_013742
2 801 bp

Arcobacter butzleri RM4018, volledige genoom.
NC_009850
2 341 251 bp

Arthrobacter aurescens TC1, volledige genoom.
NC_008711
4 597 686 bp

Arthrobacter aurescens TC1 plasmied TC1, volledige volgorde.
NC_008712
328 237 bp

Arthrobacter aurescens TC1 plasmied TC2, volledige volgorde.
NC_008713
300 725 bp

Arthrobacter chlorophenolicus A6, volledige genoom.
NC_011886
4 395 537 bp

Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmied pACHL01, volledige volgorde.
NC_011879
426 858 bp

Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmied pACHL02, volledige volgorde.
NC_011881
158 475 bp

Arthrobacter sp. FB24 chromosoom 1, volledige volgorde.
NC_008541
4 698 945 bp

Arthrobacter sp. FB24 plasmied 1, volledige volgorde.
NC_008537
159 538 bp

Arthrobacter sp. FB24 plasmied 2, volledige volgorde.
NC_008538
115 507 bp

Arthrobacter sp. FB24 plasmied 3, volledige volgorde.
NC_008539
96 488 bp

Aster geel heksebesem fitoplasma AYWB, volledige genoom.
NC_007716
706 569 bp

Aster geel heksebesem fitoplasma AYWB plasmied pAYWB-III, volledige volgorde.
NC_007719
5 104 bp

Aster geel heksebesem fitoplasma AYWB plasmied pAYWB-IV, volledige volgorde.
NC_007720
4 316 bp

Aster geel heksebesem fitoplasma AYWB plasmied pAYWB-II, volledige volgorde.
NC_007718
4 009 bp

Aster geel heksebesem fitoplasma AYWB plasmied pAYWB-I, volledige volgorde.
NC_007717
3 972 bp

Atopobium parvulum DSM 20469, volledige genoom.
NC_013203
1 543 805 bp

Azoarcus sp. BH72, volledige genoom.
NC_008702
4 376 040 bp

Azoarcus sp. EbN1, volledige genoom.
NC_006513
4 296 230 bp

Azoarcus sp. EbN1 plasmied 2, volledige volgorde.
NC_006824
223 670 bp

Azoarcus sp. EbN1 plasmied 1, volledige volgorde.
NC_006823
207 355 bp

Azorhizobium caulinodans ORS 571, volledige genoom.
NC_009937
5 369 772 bp

Azospirillum sp. B510, volledige genoom.
NC_013854
3 311 395 bp

Azospirillum sp. B510 plasmied pAB510a, volledige volgorde.
NC_013855
1 455 109 bp

Azospirillum sp. B510 plasmied pAB510b, volledige volgorde.
NC_013856
723 779 bp

Azospirillum sp. B510 plasmied pAB510c, volledige volgorde.
NC_013857
681 723 bp

Azospirillum sp. B510 plasmied pAB510d, volledige volgorde.
NC_013858
628 837 bp

Azospirillum sp. B510 plasmied pAB510e, volledige volgorde.
NC_013859
537 299 bp

Azospirillum sp. B510 plasmied pAB510f, volledige volgorde.
NC_013860
261 596 bp

Azotobacter vinelandii DJ, volledige genoom.
NC_012560
5 365 318 bp

Die BacMap-databasis is laas op Maandag 26 April 2010 bygewerk. Dit bevat tans 2023 chromosome.