Inligting

12.6: Opsporing van aansteeklike siektes - Biologie

12.6: Opsporing van aansteeklike siektes - Biologie


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Leerdoelwitte

  • Verduidelik die navorsingsbenaderings wat deur die pioniers van epidemiologie gebruik word
  • Verduidelik hoe beskrywende, analitiese en eksperimentele epidemiologiese studies te werk gaan om die oorsaak van morbiditeit en mortaliteit te bepaal

Epidemiologie het sy wortels in die werk van dokters wat gesoek het na patrone in siektevoorkoms as 'n manier om te verstaan ​​hoe om dit te voorkom. Die idee dat siektes oorgedra kan word, was 'n belangrike voorloper om sin te maak van sommige van die patrone. In 1546 het Girolamo Fracastoro die eerste keer die kiemteorie van siekte in sy opstel voorgestel De Contagione en Contagiosis Morbis, maar hierdie teorie het vir baie jare in kompetisie gebly met ander teorieë, soos die miasma-hipotese. Onsekerheid oor die oorsaak van siekte was nie 'n absolute hindernis vir die verkryging van bruikbare kennis uit siektepatrone nie. Sommige belangrike navorsers, soos Florence Nightingale, het die miasma-hipotese onderskryf. Die oorgang na aanvaarding van die kiemteorie gedurende die 19de eeu het 'n soliede meganistiese grondslag vir die studie van siektepatrone verskaf. Die studies van 19de eeuse dokters en navorsers soos John Snow, Florence Nightingale, Ignaz Semmelweis, Joseph Lister, Robert Koch, Louis Pasteur en ander het die saad van moderne epidemiologie gesaai.

Pioniers van epidemiologie

John Snow (Figuur (PageIndex{1})) was 'n Britse geneesheer bekend as die vader van epidemiologie vir die bepaling van die bron van die 1854 Broad Street-cholera-epidemie in Londen. Op grond van waarnemings wat hy tydens 'n vroeëre cholera-uitbreking (1848–1849) gemaak het, het Snow voorgestel dat cholera deur 'n fekale-orale roete van oordrag versprei word en dat 'n mikrobe die aansteeklike middel was. Hy het die cholera-epidemie van 1854 op twee maniere ondersoek. Eerstens, met die vermoede dat besmette water die bron van die epidemie was, het Snow die bron van water vir diegene wat besmet is, geïdentifiseer. Hy het 'n hoë frekwensie van cholera-gevalle gevind onder individue wat hul water van die Teemsrivier stroomaf van Londen gekry het. Hierdie water het die vullis en riool van Londen en nedersettings stroomop bevat. Hy het ook opgemerk dat brouerywerkers nie cholera opgedoen het nie en by ondersoek het gevind dat die eienaars die werkers van bier voorsien het om te drink en gesê dat hulle waarskynlik nie water gedrink het nie.1 Tweedens het hy ook die voorkoms van cholera noukeurig gekarteer en 'n hoë frekwensie gevind onder daardie individue wat 'n spesifieke waterpomp in Broadstraat gebruik. In reaksie op Snow se advies het plaaslike amptenare die pomp se handvatsel verwyder,2 wat gelei het tot die inperking van die Broad Street-cholera-epidemie.

Snow se werk verteenwoordig 'n vroeë epidemiologiese studie en dit het gelei tot die eerste bekende openbare gesondheidsreaksie op 'n epidemie. Snow se noukeurige gevalleopsporingsmetodes is nou algemene praktyk om siekte-uitbrake te bestudeer en om nuwe siektes met hul oorsake te assosieer. Sy werk het verder lig gewerp op onhigiëniese rioolpraktyke en die uitwerking van afvalstorting in die Teems. Daarbenewens het sy werk die kiemteorie van siekte ondersteun, wat aangevoer het dat siekte deur besmette items oorgedra kan word, insluitend water wat met fekale materiaal besmet is.

Snow se werk het geïllustreer wat vandag na verwys word as 'n algemene bronverspreiding van aansteeklike siektes, waarin daar 'n enkele bron is vir al die individue wat besmet is. In hierdie geval was die enkele bron die besmette goed onder die Broad Street-pomp. Tipes algemene bronverspreiding sluit in puntbronverspreiding, deurlopende algemene bronverspreiding en intermitterende algemene bronverspreiding. In puntbronverspreiding van aansteeklike siektes werk die algemene bron vir 'n kort tydperk—minder as die inkubasietydperk van die patogeen. 'n Voorbeeld van puntbronverspreiding is 'n enkele besmette aartappelslaai by 'n groeppiekniek. In deurlopende algemene bronverspreiding vind die infeksie plaas vir 'n lang tydperk, langer as die inkubasietydperk. 'n Voorbeeld van voortdurende verspreiding van algemene bron is die bron van Londense water wat stroomaf van die stad geneem is, wat voortdurend met riool van stroomop besoedel is. Laastens, met onderbroke algemene bronverspreiding, kom infeksies vir 'n tydperk voor, stop en begin dan weer. Dit kan gesien word in infeksies van 'n put wat eers na groot reënval besmet is en wat homself na 'n kort tydperk van kontaminasie skoongemaak het.

In teenstelling met algemene bronverspreiding vind voortgeplante verspreiding plaas deur direkte of indirekte persoon-tot-persoon kontak. Met voortgeplante verspreiding is daar geen enkele bron vir infeksie nie; elke besmette individu word 'n bron vir een of meer daaropvolgende infeksies. Met voortgeplante verspreiding, tensy die verspreiding onmiddellik gestaak word, vind infeksies vir langer as die inkubasietydperk plaas. Alhoewel puntbronne dikwels lei tot grootskaalse maar gelokaliseerde uitbrake van kort duur, lei voortgeplante verspreiding tipies tot langer duur uitbrake wat van klein tot groot kan wissel, afhangende van die bevolking en die siekte (Figuur (PageIndex{2}) ). Daarbenewens, as gevolg van persoon-tot-persoon-oordrag, kan voortgeplante verspreiding nie maklik by 'n enkele bron soos puntbronverspreiding gestop word nie.

Florence Nightingale se werk is nog 'n voorbeeld van 'n vroeë epidemiologiese studie. In 1854 was Nightingale deel van 'n kontingent verpleegsters wat deur die Britse weermag uitgestuur is om gewonde soldate tydens die Krim-oorlog te versorg. Nightingale het noukeurig rekord gehou van die oorsake van siekte en dood tydens die oorlog. Haar rekordhouding was 'n fundamentele taak van wat later die wetenskap van epidemiologie sou word. Haar ontleding van die data wat sy ingesamel het, is in 1858 gepubliseer. In hierdie boek het sy maandelikse frekwensiedata oor oorsake van dood in 'n wiggrafiekhistogram aangebied (Figuur (PageIndex{3})). Hierdie grafiese aanbieding van data, destyds ongewoon, het kragtig geïllustreer dat die oorgrote meerderheid van die ongevalle tydens die oorlog plaasgevind het nie as gevolg van wonde wat in aksie opgedoen is nie, maar aan wat Nightingale as voorkombare aansteeklike siektes beskou het. Dikwels het hierdie siektes plaasgevind as gevolg van swak sanitasie en 'n gebrek aan toegang tot hospitaalfasiliteite. Nightingale se bevindings het gelei tot baie hervormings in die Britse weermag se stelsel van mediese sorg.

Joseph Lister het vroeë epidemiologiese bewyse verskaf wat lei tot goeie openbare gesondheidspraktyke in klinieke en hospitale. Hierdie instellings was berug in die middel 1800's vir dodelike infeksies van chirurgiese wonde in 'n tyd toe die kiemteorie van siekte nog nie algemeen aanvaar is nie. Die meeste dokters het nie hul hande tussen pasiëntbesoeke gewas of hul chirurgiese gereedskap skoongemaak en gesteriliseer nie. Lister het egter die ontsmettingseienskappe van karbolsuur, ook bekend as fenol, ontdek. Hy het verskeie ontsmettingsprotokolle ingestel wat die post-chirurgiese infeksiesyfers dramaties verlaag het.3 Hy het geëis dat chirurge wat vir hom gewerk het 'n 5%-karbolsuuroplossing gebruik om hul chirurgiese gereedskap tussen pasiënte skoon te maak, en het selfs so ver gegaan om die oplossing tydens operasies op verbande en oor die chirurgiese plek te spuit (Figuur (PageIndex{4) })). Hy het ook voorsorg getref om nie bronne van infeksie van sy vel of klere in te voer deur sy jas uit te trek, sy moue op te rol en sy hande voor en tydens die operasie in 'n verdunde oplossing van karbolsuur te was nie.

Besoek die webwerf vir Die Spookkaart, 'n boek oor Snow se werk wat verband hou met die Broad Street-pomp-cholera-uitbraak.

John Snow se eie weergawe van sy werk het bykomende skakels en inligting.

Hierdie CDC-hulpbron breek die patroon wat verwag word van 'n puntbron-uitbraak verder af.

Kom meer te wete oor Nightingale se wiggrafiek hier.

Oefening (PageIndex{1})

  1. Verduidelik die verskil tussen algemene bronverspreiding en voortgeplante verspreiding van siektes.
  2. Beskryf hoe die waarnemings van John Snow, Florence Nightingale en Joseph Lister tot verbeterings in openbare gesondheid gelei het.

Tipes epidemiologiese studies

Vandag maak epidemioloë gebruik van studie-ontwerpe, die manier waarop data ingesamel word om 'n hipotese te toets, soortgelyk aan dié van navorsers wat ander verskynsels bestudeer wat in bevolkings voorkom. Hierdie benaderings kan verdeel word in waarnemingstudies (waarin proefpersone nie gemanipuleer word nie) en eksperimentele studies (waarin proefpersone gemanipuleer word). Gesamentlik gee hierdie studies hedendaagse epidemioloë verskeie hulpmiddels om die verbande tussen aansteeklike siektes en die bevolkings van vatbare individue wat hulle kan besmet, te ondersoek.

Waarnemingstudies

In 'n waarnemingstudie word data van studiedeelnemers ingesamel deur metings (soos fisiologiese veranderlikes soos witbloedseltelling), of antwoorde op vrae in onderhoude (soos onlangse reis- of oefenfrekwensie). Die proefpersone in 'n waarnemingstudie word tipies lukraak gekies uit 'n populasie van geaffekteerde of ongeaffekteerde individue. Die proefpersone in 'n waarnemingstudie word egter geensins deur die navorser gemanipuleer nie. Waarnemingstudies is tipies makliker om uit te voer as eksperimentele studies, en in sekere situasies kan dit die enigste studies wees wat om etiese redes moontlik is.

Waarnemingstudies is slegs in staat om assosiasies tussen siektevoorkoms en moontlike veroorsakende middels te meet; hulle bewys nie noodwendig 'n oorsaaklike verband nie. Gestel byvoorbeeld 'n studie vind 'n verband tussen swaar koffiedrinkery en laer voorkoms van velkanker. Dit kan daarop dui dat koffie velkanker voorkom, maar daar kan nog 'n ongemeet faktor betrokke wees, soos die hoeveelheid sonblootstelling wat die deelnemers ontvang. As dit blyk dat koffiedrinkers meer in kantore werk en minder tyd buite in die son deurbring as diegene wat minder koffie drink, dan is dit dalk moontlik dat die laer koers van velkanker te wyte is aan minder sonblootstelling, nie aan koffieverbruik nie. Die waarnemingstudie kan nie tussen hierdie twee potensiële oorsake onderskei nie.

Daar is verskeie nuttige benaderings in waarnemingstudies. Dit sluit metodes in wat geklassifiseer word as beskrywende epidemiologie en analitiese epidemiologie. Beskrywende epidemiologie versamel inligting oor 'n siekte-uitbraak, die geaffekteerde individue en hoe die siekte oor tyd versprei het in 'n verkennende stadium van studie. Hierdie tipe studie sal onderhoude met pasiënte, hul kontakte en hul familielede behels; ondersoek van monsters en mediese rekords; en selfs geskiedenis van kos en drank wat verbruik is. So 'n studie kan uitgevoer word terwyl die uitbraak nog plaasvind. Beskrywende studies kan die basis vorm vir die ontwikkeling van 'n hipotese van oorsaaklikheid wat deur strenger waarnemings- en eksperimentele studies getoets kan word.

Analitiese epidemiologie gebruik noukeurig geselekteerde groepe individue in 'n poging om hipoteses oor potensiële oorsake vir 'n siekte-uitbraak meer oortuigend te evalueer. Die keuse van gevalle word oor die algemeen lukraak gemaak, so die resultate is nie bevooroordeeld as gevolg van een of ander algemene kenmerk van die studiedeelnemers nie. Analitiese studies kan hul data versamel deur terug te gaan in tyd (retrospektiewe studies), of soos gebeure vorentoe in tyd ontvou (voornemende studies).

Retrospektiewe studies versamel data uit die verlede oor hedendaagse gevalle. Data kan dinge soos die mediese geskiedenis, ouderdom, geslag of beroepsgeskiedenis van die geaffekteerde individue insluit. Hierdie tipe studie ondersoek assosiasies tussen faktore wat vir die navorser gekies of beskikbaar is en siektevoorkoms.

Voornemende studies volg individue en monitor hul siektetoestand gedurende die loop van die studie. Data oor die kenmerke van die studie proefpersone en hul omgewings word aan die begin en tydens die studie ingesamel sodat proefpersone wat siek word vergelyk kan word met diegene wat dit nie doen nie. Weereens kan die navorsers kyk vir assosiasies tussen die siektetoestand en veranderlikes wat tydens die studie gemeet is om lig te werp op moontlike oorsake.

Analitiese studies inkorporeer groepe in hul ontwerpe om te help om assosiasies met siektes uit te roei. Benaderings tot groepgebaseerde analitiese studies sluit in kohortstudies, gevallekontrolestudies en deursneestudies. Die kohortmetode ondersoek groepe individue (genoem kohorte) wat 'n bepaalde eienskap deel. Byvoorbeeld, 'n kohort kan bestaan ​​uit individue wat in dieselfde jaar en dieselfde plek gebore is; of dit kan bestaan ​​uit mense wat 'n bepaalde gedrag beoefen of vermy, bv. rokers of nie-rokers. In 'n kohortstudie kan kohorte prospektief gevolg word of retrospektief bestudeer word. As slegs 'n enkele kohort gevolg word, word die geaffekteerde individue vergelyk met die ongeaffekteerde individue in dieselfde groep. Siekte-uitkomste word aangeteken en ontleed om korrelasies tussen eienskappe van individue in die kohort en siektevoorkoms te probeer identifiseer. Kohortstudies is 'n nuttige manier om die oorsake van 'n toestand te bepaal sonder om die etiese verbod op die blootstelling van proefpersone aan 'n risikofaktor te oortree. Kohorte word tipies geïdentifiseer en gedefinieer op grond van vermeende risikofaktore waaraan individue reeds deur hul eie keuses of omstandighede blootgestel is.

Gevallekontrole studies is tipies retrospektief en vergelyk 'n groep individue met 'n siekte met 'n soortgelyke groep individue sonder die siekte. Gevallekontrolestudies is baie meer doeltreffend as kohortstudies omdat navorsers doelbewus proefpersone kan kies wat reeds met die siekte geaffekteer is, eerder as om te wag om te sien watter proefpersone uit 'n ewekansige steekproef 'n siekte sal ontwikkel.

'n Deursnitstudie ontleed ewekansig geselekteerde individue in 'n populasie en vergelyk individue wat deur 'n siekte of toestand geraak word met dié wat nie op 'n enkele tydstip geraak is nie. Vakke word vergelyk om te kyk vir assosiasies tussen sekere meetbare veranderlikes en die siekte of toestand. Dwarssnitstudies word ook gebruik om die voorkoms van 'n toestand te bepaal.

Eksperimentele Studies

Eksperimentele epidemiologie gebruik laboratorium- of kliniese studies waarin die ondersoeker die studievakke manipuleer om die verbande tussen siektes en potensiële veroorsakende middels te bestudeer of om behandelings te assesseer. Voorbeelde van behandelings kan die toediening van 'n geneesmiddel, die insluiting of uitsluiting van verskillende dieetitems, fisiese oefening of 'n spesifieke chirurgiese prosedure wees. Diere of mense word as proefpersone gebruik. Omdat eksperimentele studies manipulasie van proefpersone behels, is dit tipies moeiliker en soms onmoontlik om etiese redes.

Koch se postulate vereis eksperimentele intervensies om die veroorsakende middel vir 'n siekte te bepaal. Anders as waarnemingstudies, kan eksperimentele studies sterk bewyse verskaf wat oorsaak ondersteun omdat ander faktore tipies konstant gehou word wanneer die navorser die onderwerp manipuleer. Die uitkomste vir een groep wat die behandeling ontvang, word vergelyk met uitkomste vir 'n groep wat nie die behandeling ontvang nie maar op elke ander manier dieselfde behandel word. Byvoorbeeld, een groep kan 'n regime van 'n geneesmiddel ontvang wat as 'n pil toegedien word, terwyl die onbehandelde groep 'n placebo ontvang ('n pil wat dieselfde lyk maar geen aktiewe bestanddeel het nie). Beide groepe word so eenders as moontlik behandel behalwe vir die toediening van die geneesmiddel. Omdat ander veranderlikes konstant gehou word in beide die behandelde en die onbehandelde groepe, is die navorser meer seker dat enige verandering in die behandelde groep die gevolg is van die spesifieke manipulasie.

Eksperimentele studies verskaf die sterkste bewyse vir die etiologie van siekte, maar hulle moet ook versigtig ontwerp word om subtiele effekte van vooroordeel uit te skakel. Tipies word eksperimentele studies met mense as dubbelblinde studies uitgevoer, wat beteken dat nie die proefpersone of die navorsers weet wie 'n behandelingsgeval is en wie nie. Hierdie ontwerp verwyder 'n bekende oorsaak van vooroordeel in navorsing wat die placebo-effek genoem word, waarin kennis van die behandeling deur óf die proefpersoon óf die navorser die uitkomste kan beïnvloed.

Oefening (PageIndex{2})

  1. Beskryf die voordele en nadele van waarnemingstudies en eksperimentele studies.
  2. Verduidelik die maniere waarop groepe proefpersone vir analitiese studies gekies kan word.

Sleutelbegrippe en opsomming

  • Vroeë pioniers van epidemiologie soos John Snow, Florence Nightingale en Joseph Lister, het siekte op bevolkingsvlak bestudeer en data gebruik om die oordrag van siektes te ontwrig.
  • Beskrywende epidemiologie studies maak staat op gevalle-analise en pasiëntgeskiedenis om inligting oor uitbrake te bekom, dikwels terwyl hulle nog plaasvind.
  • Retrospektiewe epidemiologie studies gebruik historiese data om assosiasies met die siektetoestand van huidige gevalle te identifiseer. Voornemende epidemiologie studies versamel data en volg gevalle om assosiasies met toekomstige siektetoestande te vind.
  • Analitiese epidemiologie studies is waarnemingstudies wat sorgvuldig ontwerp is om groepe te vergelyk en assosiasies tussen omgewings- of genetiese faktore en siektes te ontdek.
  • Eksperimentele epidemiologie studies genereer sterk bewyse van oorsaaklikheid in siekte of behandeling deur vakke te manipuleer en hulle met kontrolevakke te vergelyk.
  1. John Snow. Oor die wyse van kommunikasie van cholera. Tweede uitgawe, Baie vergroot. John Churchill, 1855.
  2. John Snow. "Die Cholera naby Golden-Wquare en by Deptford." Mediese Tye en Koerant 9 (1854): 321–322. http://www.ph.ucla.edu/epi/snow/chol...densquare.html.
  3. O.M. Lidwell. "Joseph Lister en infeksie uit die lug." Epidemiologie en infeksie 99 (1987): 569–578. www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/arti...00006-0004.pdf.

Die gevolge van 'n DMV-benadering tot aansteeklike siektes

Een van die herhalende temas wat ek herhaal wanneer dit kom by watter aansteeklike siekte-noodgeval die wêreld ook al in die gesig staar, is dat baie van die kundigheid om op hierdie steeds ontwikkelende bedreigings te reageer, by openbare gesondheidsagentskappe geleë is. Hierdie agentskappe wissel in diepte en kundigheid van die CDC aan die een kant van die spektrum tot 'n plaaslike gesondheidsdepartement aan die ander kant. Terwyl aansteeklike siektes bestuur is regtig die bestaansrede van openbare gesondheid en is hul kern en oorspronklike funksie, het die afgelope dekades die publieke gesondheidsagentskap se uitstallingsmissie laat kruip. Nou balanseer openbare gesondheidsagentskappe dikwels die eise vir die ontwikkeling van 'n plan vir die aanpak van vetsug met een om die verspreiding van tuberkulose te voorkom. Sulke, na my mening, afleidings van hul fundamentele rol deprioritiseer aansteeklike siektes op 'n riskante manier. Gisteraand het ek nog 'n stukkie data gekry wat ek bygevoeg het om my standpunt te ondersteun.

As iemand wat ook opgelei is in noodgeneeskunde -- benewens aansteeklike siektes en kritiekesorgmedisyne -- probeer ek om my hand in die veld te hou met 'n paar toevallige skofte in my tuisdorp se hospitaal se noodafdeling. As 'n dokter vir aansteeklike siektes, is ek egter altyd op die uitkyk vir interessante gevalle van aansteeklike siektes wat ek kan pluk uit die talle klagtes wat mense na die ED bring.

Gister het ek daardie geleentheid gehad toe ek 'n pasiënt sien wat onlangs teruggekeer het van 'n Zika-belaaide gebied van die wêreld wat simptome gehad het wat heeltemal met Zika ooreenstem. Die saak was ongekompliseerd en sal waarskynlik selfbeperk wees, soos die meeste Zika-gevalle is. Maar, altyd bewus van die epidemiologiese belangrikheid van die diagnose van sekere aansteeklike siektes, het ek geglo die pasiënt verdien bevestigende toetsing. Sulke toetse is grootliks die provinsie van die staatsdepartement van gesondheid (alhoewel kommersiële toetse beskikbaar is) en vereis daarom konsultasie om te reël dat toetsing plaasvind.

Omdat dit na-ure was (aansteeklike siektes is gereeld nie net 9-5 patogene nie), was ek voorspelbaar gefrustreerd met die staatsdepartement se gesondheidsreaksie, aangesien dit 'n geruime tyd geneem het om 'n persoon te bereik wat die toets kon "goedkeur", wat amper uitgevoer is. uitsluitlik vir openbare gesondheidsdoeleindes aangesien my behandeling van die pasiënt nie deur die uitslag van die toets beïnvloed sou word nie. Nodeloos om te sê, 'n na-uurse navrae waarin 'n mens moet navigeer en terugspring tussen telefoonnommers met aangetekende boodskappe en 'n antwoorddiens wat nie die behoeftes van 'n oproeper effektief kan verstaan ​​of toets nie, is die teenoorgestelde van die flinke reaksie wat nodig is om aansteeklike siekte-noodgevalle behendig te bestuur . Dit is wat 'n mens van die DMV verwag.

Tot sy eer het ek wel die nodige inligting van professionele en kundige gesondheidsdepartementpersoneel ontvang, maar ek sou sê dat die moeilikheid wat ek opgedoen het om hierdie inligting te bekom, waarskynlik iets is wat baie dokters nie sal verduur nie - 'n gevaarlike situasie wat die vermoë beperk om te hê volle situasiebewustheid van aansteeklike siektes wat sirkuleer. Ek is 'n onomwonde voorstander daarvan om aansteeklike siektes met die nodige invoer aan te meld en kan net dink hoeveel gesondheidsorgverskaffers verstaan ​​nie deur die burokratiese prosesse wat nodig is om te verseker dat toepaslike toetsing en kennisgewing plaasvind nie. Dit is dus genoeg om te sê, die Zika-saakverslae in die VSA is waarskynlik 'n onderskatting.

Ek sou graag wou dink dat hierdie verskynsel nie so maklik sou voorkom as die oorspronklike fokus van die departement ongeskonde gebly het en hul hulpbronne nie so ver van hul oorspronklike aansteeklike siekte-missie verstrooi was nie.


NGS vir aansteeklike siektes

NGS bied kragtige en omvattende oplossings vir die opsporing en karakterisering van aansteeklike siektes

Genomika in aansteeklike siektes

Genomika verander ons begrip van aansteeklike siektes, patogeen-evolusie, siekte-oordrag, gasheer-patogeen-interaksies en antibiotika-weerstandigheid. Op hul beurt verander openbare gesondheidswerkers die metodes wat hulle gebruik om epidemies en pandemies van hoëprofiel-aansteeklike siektes soos griep, tuberkulose, Ebola en meer onlangs koronavirus na te vors en te monitor.

Tradisionele metodes om aansteeklike middels te assesseer sluit in teenliggaamgebaseerde toetsing, intydse PCR, gepulseerde veldgelelektroforese en multilokus-volgordetipering. Hierdie metodes is tipies slegs nuttig vir 'n klein en gedefinieerde aantal organismes, en data-analise kan subjektief wees. Daarteenoor bied volgende generasie volgordebepaling (NGS) 'n universele, kultuurvrye metode vir karakterisering en toesig van aansteeklike siektes wat gebruik kan word met virusse, bakterieë, swamme en parasiete, en kan die behoefte aan veelvuldige toetse vervang.

NGS en die stryd teen COVID-19

Koronavirus-volgordebepaling

Vergelyk NGS-metodes en vind oplossings om SARS-CoV2 op te spoor en te karakteriseer, oordragroetes op te spoor, mede-infeksies te identifiseer en virale oordragweë en evolusie te bestudeer.

Gasheerrisiko en reaksie

Studies van gasheer genetiese verskille en individuele immuunreaksies op aansteeklike siektes soos SARS-CoV-2 kan begrip van siekte vatbaarheid en erns verhoog.

Gasheer-Patogeen-interaksies

NGS fasiliteer studies van gasheer- en patogeengeenuitdrukking en die invloed van die mikrobioom.

Dwelmontdekking en ontwikkeling

NGS laat geneesmiddelontwikkelaars toe om genomiese variasie te verken, wat die identifikasie, validering en kliniese ontwikkeling van geneesmiddelteikens kan inlig.

Respiratoriese Patogeen NGS-oplossings

Bedryf metagenomiese opsporing en karakterisering van respiratoriese patogene

Die COVID-19-pandemie het die behoefte aan nuwe instrumente beklemtoon om opkomende patogene soos SARS-CoV-2 op te spoor en te monitor. Saam met die Illumina Respiratory Virus Oligo Panel (RVOP), bied die pasgemaakte Explify RVOP-analise-app van IDbyDNA 'n monster-tot-resultaat metagenomika-oplossing.

Bespeur respiratoriese patogene en geassosieerde weerstandsgene

Vinnige teikenverrykingswerkvloei vir breë opsporing van respiratoriese patogene (insluitend SARS-CoV-2 en griepvirusse) en antimikrobiese weerstandsgene.

Bespeur respiratoriese virusse vinnig op Illumina MiniSeq-stelsel

Opsporing van respiratoriese virusse insluitend koronavirus in <24 uur met behulp van NGS met die MiniSeq-bank-volgorder.

Vind en karakteriseer respiratoriese virusse met teikenverryking

'n Vinnige teikenverrykingsvolgorde-werkvloei vir hoogs sensitiewe opsporing en karakterisering van respiratoriese virusse, insluitend COVID-19-stamme.

NGS vir toesig oor aansteeklike siektes

Genomiese analise met NGS verskaf hoë-resolusie inligting om patogeenstamme te onderskei wat met so min as een enkelnukleotied polimorfisme (SNP) verskil. Dit maak ook identifikasie van nuwe en bekende aansteeklike middels moontlik.

NGS-tegnologie lewer vinnige resultate en data van hoë gehalte om wetenskaplikes en openbare gesondheidswerkers te help om aansteeklike siekte-agente te identifiseer en op te spoor en op uitbrake te reageer.

Hoe volgorde-gebaseerde toesig help om COVID-19 te beveg

Hoof Mediese Beampte Phil Febbo, besturende direkteur, bespreek hoe openbare amptenare die pad van die epidemie volg en wat dit beteken om die verspreiding van virale mutasies op te spoor.


Spoor soönotiese patogene op deur bloedsuiende vlieë as 'vlieënde spuite' te gebruik

Ongeveer 60% van opkomende aansteeklike siektes by mense is van soönotiese oorsprong. Hul toenemende aantal vereis die ontwikkeling van nuwe metodes vir vroeë opsporing en monitering van aansteeklike middels in wild. Hier het ons ondersoek ingestel of bloedmaaltye van hematofage vlieë gebruik kan word om die aansteeklike middels wat in wilde gewerwelde diere sirkuleer, te identifiseer. Om hierdie doel te bereik, is 1230 bloed-verswelde vlieë in die woude van Gaboen gevang. Geïdentifiseerde bloedmaaltye (30%) was van 20 gewerwelde spesies insluitend soogdiere, voëls en reptiele. Onder hulle is 9% deur verskillende bestaande malariaparasiete besmet, waaronder sommige aan bekende parasietspesies behoort het, ander aan nuwe parasietspesies of aan parasietafstammelinge waarvoor slegs die vektor bekend was. Hierdie studie demonstreer dat die gebruik van hematofage vlieë as 'vlieënde spuite' 'n interessante benadering is om bloedgedraagde patogeendiversiteit in wilde vertebrate te ondersoek en as 'n vroeë opsporingsinstrument van soönotiese patogene gebruik kan word.

Sleutelwoorde: Plasmodium parasiete ekologie epidemiologie globale gesondheid hematofage vlieë tsetse vlieë.

Verklaring van belangebotsing

Die skrywers verklaar dat geen mededingende belange bestaan ​​nie.

Syfers

Figuur 1. Monitering van vertebrate hemosporidiese diversiteit deur gebruik te maak van...

Figuur 1. Monitering van vertebrate hemosporidiese diversiteit met behulp van hematofage vlieë.

( a ) Lokalisering van die...

Figuur 2. Aantal bloedmaaltye geïdentifiseer...

Figuur 2.. Aantal bloedmaaltye geïdentifiseer deur die korter PCR-stelsel van Boessenkool et...


Vinnige en onbeperkte deel van data en navorsingshulpbronne is noodsaaklik vir die bevordering van navorsing oor menslike gesondheid en aansteeklike siektes. Die nut van data en hulpbronne vir die wetenskaplike gemeenskap is grootliks afhanklik van hoe vinnig hierdie data in openbare databasisse gedeponeer word, of die data maklik is om te vind, toeganklik en deur ander hergebruik kan word. NIAID is verbind tot vinnige vrystelling van eksperimentele data, insluitend genomiese en ander grootskaalse datatipes en erken ook dat kliniese data en ander metadata wat met die genomiese, -omika en ander data geassosieer word, waardevolle navorsingsbronne is.

Die NIAID/DMID Systems Biology Consortium for Infectious Diseases bied 'n maandelikse webinarreeks aan om die kundigheid, tegnologiese vooruitgang en wetenskaplike deurbrake by elk van die sentrums te deel, en dien as 'n platform om samewerking en kennisdeling te bevorder. Hierdie lesingreeks sluit lede van die NIAID/DMID Systems Biology Consortium, loodskomitee, NIAID en ander genooide wetenskaplikes in. Maandelikse lesings word aangebied deur deelnemende of genooide wetenskaplikes, wat wissel van senior ondersoekers tot gegradueerde studentenavorsers.


12.6: Opsporing van aansteeklike siektes - Biologie

Alle artikels wat deur MDPI gepubliseer word, word onmiddellik wêreldwyd beskikbaar gestel onder 'n ooptoeganglisensie. Geen spesiale toestemming word vereis om die hele of 'n gedeelte van die artikel wat deur MDPI gepubliseer is, te hergebruik nie, insluitend syfers en tabelle. Vir artikels wat onder 'n ooptoegang Creative Common CC BY-lisensie gepubliseer is, mag enige deel van die artikel sonder toestemming hergebruik word, mits die oorspronklike artikel duidelik aangehaal word.

Feature Papers verteenwoordig die mees gevorderde navorsing met beduidende potensiaal vir 'n hoë impak in die veld. Spesifieke referate word op individuele uitnodiging of aanbeveling deur die wetenskaplike redakteurs ingedien en ondergaan ewekniebeoordeling voor publikasie.

Die hoofartikel kan óf 'n oorspronklike navorsingsartikel wees, 'n aansienlike nuwe navorsingstudie wat dikwels verskeie tegnieke of benaderings behels, óf 'n omvattende oorsigartikel met bondige en presiese opdaterings oor die jongste vordering in die veld wat sistematies die opwindendste vooruitgang in wetenskaplike letterkunde. Hierdie tipe vraestel bied 'n uitkyk op toekomstige navorsingsrigtings of moontlike toepassings.

Editor's Choice-artikels is gebaseer op aanbevelings deur die wetenskaplike redakteurs van MDPI-tydskrifte van regoor die wêreld. Redakteurs kies 'n klein aantal artikels wat onlangs in die joernaal gepubliseer is wat hulle glo veral interessant sal wees vir skrywers, of belangrik sal wees in hierdie veld. Die doel is om 'n momentopname te verskaf van van die opwindendste werk wat in die verskillende navorsingsareas van die joernaal gepubliseer is.


Epidemiologie van aansteeklike siektes

Die doel van die Infeksiesiekte-baan is om voort te bou op die kernepidemiologiekurrikulum om die vereiste kennis van die epidemiologie, analitiese en laboratoriummetodologie, immunologie en patogeenbiologie te ontwikkel wat nodig is om die interaksies van aansteeklike middels en hul gashere, vektore en omgewing te verstaan.

Fakulteit en studente oorweeg hoe om infeksies die beste te identifiseer en te meet, oordragdinamika te verstaan, en voorkomings- en behandelingsprogramme te ontwikkel en te assesseer vir opkomende en gevestigde aansteeklike siektes soos MIV/VIGS, hepatitis C-virus, menslike papillomavirus, malaria, masels, tuberkulose, griep en dengue hemorragiese koors.

Studente binne die program vind baat by kursuswerk in mikrobiologie en immunologie, epidemiologiese metodes en statistiese ontledings, sowel as die breë spektrum kursusse oor aansteeklike siektes wat in die Departement Epidemiologie en ander departemente binne die skool aangebied word. Studente het die geleentheid om betrokke te raak by plaaslike en internasionale projekte onder toesig van die fakulteit binne Infeksiesiekte Epidemiologie.


T-sel limfomatiese virus

T-sel limfomatiese virusse is die eerste menslike retrovirus wat ontdek is. Dit behoort aan die klas Lentivirus. Die meeste pasiënte wat met hierdie virus geraak word, het meer kanse om leukemie te ontwikkel. Sommige mense kan aansteeklike siektes of ander inflammatoriese afwykings ontwikkel. Simptome sluit in swakheid, gevoelloosheid en styfheid in die bene, moeilikheid om te loop en ontsteking van oë. Die risiko van infeksie kom voor by die persone wat herhaalde inspuitingsgebruikers is. Sommige mense kan die infeksie ontwikkel deur seksuele kontak met die inspuitinggebruikers. Die virus is gekoppel aan neuro-degeneratiewe afwykings.

Verwante joernale van T-sel limfomatiese virus

Bakteriologie-joernaal, Kliniese Aansteeklike Siekte-joernaal, Immunologie-joernaal, Neuro-infeksiesiekte-joernaal, Infeksiesiektes-joernaal, Patologie-joernaal, Kliniese Limfoom, Myeloom en Leukemie, Tydskrif vir Leukemie en Limfoom, Leukemie en Limfoom.


Toepassing Vereistes

  • Algemene UCF-gegradueerde aansoekvereistes
  • Een amptelike transkripsie (in 'n verseëlde koevert) van elke kollege/universiteit wat bygewoon is
  • Amptelike, mededingende GRE-telling geneem binne die afgelope vyf jaar of MCAT-telling geneem binne die afgelope drie jaar
  • Drie aanbevelingsbriewe
  • 'n Skriftelike verklaring van navorsingservaring, belangstellingsarea en onmiddellike en langtermyndoelwitte
  • Hervat
  • Minimum TOEFL (indien van toepassing)

Aansoekers hoef nie 'n voorgraadse graad in molekulêre biologie of mikrobiologie te hê nie, maar daar word verwag om die ekwivalent van 16 semester-ure se krediet in die biologiese wetenskappe te hê, insluitend 'n kursus in algemene mikrobiologie, biochemie of molekulêre biologie of selbiologie, plus een jaar van organiese chemie , een jaar fisika, basiese universiteitswiskunde en statistiek, en laboratoriumvaardighede gelykstaande aan die minimum wat van ons eie voorgraadse studente vereis word.

Finansies

*Nie-tesisstudente word nie vir departementele gegradueerde assistentskappe of onderrigbystand oorweeg nie.


Aansteeklike siektes en entstof

Die studie van aansteeklike siektes fokus op interaksies tussen aansteeklike middels, hul gashere en die omgewing wat tot siektes by mense kan lei. Ons skep geleenthede vir studente om nuwe en gevorderde kennis op te doen oor aansteeklike siekte-agente en hoe hulle met gasheerselle, menslike bevolkings en die omgewing omgaan.

Students learn how to design and implement independent investigations using interdisciplinary approaches. The goal is to promote public health through better understanding of infectious diseases and human immunology based on the interaction of basic and translational research that contributes to the development of new diagnostics, treatment, prevention, and the control of human infectious diseases.

Infectious Diseases and Immunity

This wet lab infectious disease research program focuses on immune response, vaccine development and microbiome research. We emphasize integrated multidisciplinary training and multiple areas of inquiry, including the biology of host-pathogen interactions, the ecology of disease agents, molecular and cellular aspects of pathogenesis, and surveillance and epidemiological analysis, as well as vaccine and disease prevention and control.

Infectious Diseases and Vaccinology

In this multidisciplinary program, we train students to understand the interactions between infectious diseases, their hosts and the environment that may lead to the spread of disease. Topics include the biology of host-pathogen interactions, host immune response to infection, the evolution and transmission of infectious agents, and laboratory methods of infectious disease surveillance.


Kyk die video: genetica - X-chromosomale kruising (Oktober 2022).